Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tnpo1Q8BFY9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tnpo1Q8BFY9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tnpo1Q8BFY9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tnpo1Q8BFY9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tnpo1Q8BFY9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tnpo1Q8BFY9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tnpo1Q8BFY9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tnpo1Q8BFY9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tnpo1Q8BFY9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tnpo1Q8BFY9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tnpo1Q8BFY9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tnpo1Q8BFY9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tnpo1Q8BFY9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tnpo1Q8BFY9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tnpo1Q8BFY9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tnpo1Q8BFY9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tnpo1Q8BFY9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tnpo1Q8BFY9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tnpo1Q8BFY9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tnpo1Q8BFY9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tnpo1Q8BFY9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tnpo1Q8BFY9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tnpo1Q8BFY9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tnpo1Q8BFY9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tnpo1Q8BFY9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tnpo1Q8BFY9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tnpo1Q8BFY9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tnpo1Q8BFY9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tnpo1Q8BFY9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Tnpo1Q8BFY9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tnpo1Q8BFY9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tnpo1Q8BFY9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tnpo1Q8BFY9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tnpo1Q8BFY9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tnpo1Q8BFY9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tnpo1Q8BFY9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tnpo1Q8BFY9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tnpo1Q8BFY9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tnpo1Q8BFY9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tnpo1Q8BFY9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tnpo1Q8BFY9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tnpo1Q8BFY9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tnpo1Q8BFY9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tnpo1Q8BFY9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tnpo1Q8BFY9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tnpo1Q8BFY9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tnpo1Q8BFY9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tnpo1Q8BFY9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tnpo1Q8BFY9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tnpo1Q8BFY9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tnpo1Q8BFY9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tnpo1Q8BFY9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tnpo1Q8BFY9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tnpo1Q8BFY9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tnpo1Q8BFY9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tnpo1Q8BFY9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tnpo1Q8BFY9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tnpo1Q8BFY9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tnpo1Q8BFY9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tnpo1Q8BFY9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tnpo1Q8BFY9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tnpo1Q8BFY9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tnpo1Q8BFY9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tnpo1Q8BFY9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tnpo1Q8BFY9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tnpo1Q8BFY9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tnpo1Q8BFY9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tnpo1Q8BFY9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tnpo1Q8BFY9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tnpo1Q8BFY9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tnpo1Q8BFY9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tnpo1Q8BFY9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tnpo1Q8BFY9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tnpo1Q8BFY9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tnpo1Q8BFY9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Tnpo1Q8BFY9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Tnpo1Q8BFY9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Tnpo1Q8BFY9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Tnpo1Q8BFY9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tnpo1Q8BFY9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tnpo1Q8BFY9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Tnpo1Q8BFY9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tnpo1Q8BFY9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tnpo1Q8BFY9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tnpo1Q8BFY9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tnpo1Q8BFY9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tnpo1Q8BFY9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tnpo1Q8BFY9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tnpo1Q8BFY9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Tnpo1Q8BFY9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tnpo1Q8BFY9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tnpo1Q8BFY9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tnpo1Q8BFY9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tnpo1Q8BFY9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tnpo1Q8BFY9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tnpo1Q8BFY9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tnpo1Q8BFY9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Tnpo1Q8BFY9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Tnpo1Q8BFY9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms