Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nphp3Q7TNH6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nphp3Q7TNH6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nphp3Q7TNH6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nphp3Q7TNH6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nphp3Q7TNH6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nphp3Q7TNH6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nphp3Q7TNH6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nphp3Q7TNH6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nphp3Q7TNH6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nphp3Q7TNH6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nphp3Q7TNH6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nphp3Q7TNH6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nphp3Q7TNH6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Nphp3Q7TNH6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nphp3Q7TNH6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nphp3Q7TNH6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nphp3Q7TNH6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nphp3Q7TNH6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nphp3Q7TNH6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nphp3Q7TNH6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nphp3Q7TNH6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nphp3Q7TNH6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nphp3Q7TNH6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nphp3Q7TNH6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nphp3Q7TNH6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nphp3Q7TNH6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nphp3Q7TNH6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nphp3Q7TNH6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nphp3Q7TNH6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nphp3Q7TNH6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nphp3Q7TNH6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nphp3Q7TNH6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nphp3Q7TNH6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nphp3Q7TNH6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nphp3Q7TNH6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nphp3Q7TNH6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nphp3Q7TNH6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Nphp3Q7TNH6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nphp3Q7TNH6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nphp3Q7TNH6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nphp3Q7TNH6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nphp3Q7TNH6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nphp3Q7TNH6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nphp3Q7TNH6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nphp3Q7TNH6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nphp3Q7TNH6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nphp3Q7TNH6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nphp3Q7TNH6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nphp3Q7TNH6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nphp3Q7TNH6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nphp3Q7TNH6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nphp3Q7TNH6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Nphp3Q7TNH6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nphp3Q7TNH6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nphp3Q7TNH6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nphp3Q7TNH6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nphp3Q7TNH6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Nphp3Q7TNH6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nphp3Q7TNH6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nphp3Q7TNH6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nphp3Q7TNH6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nphp3Q7TNH6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Nphp3Q7TNH6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nphp3Q7TNH6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nphp3Q7TNH6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nphp3Q7TNH6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nphp3Q7TNH6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nphp3Q7TNH6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nphp3Q7TNH6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nphp3Q7TNH6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nphp3Q7TNH6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nphp3Q7TNH6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nphp3Q7TNH6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nphp3Q7TNH6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nphp3Q7TNH6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nphp3Q7TNH6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nphp3Q7TNH6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nphp3Q7TNH6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nphp3Q7TNH6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nphp3Q7TNH6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nphp3Q7TNH6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nphp3Q7TNH6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nphp3Q7TNH6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nphp3Q7TNH6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nphp3Q7TNH6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nphp3Q7TNH6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nphp3Q7TNH6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nphp3Q7TNH6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nphp3Q7TNH6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nphp3Q7TNH6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nphp3Q7TNH6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nphp3Q7TNH6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nphp3Q7TNH6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29■■■□□ 2.23
Nphp3Q7TNH6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Nphp3Q7TNH6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nphp3Q7TNH6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nphp3Q7TNH6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nphp3Q7TNH6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nphp3Q7TNH6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms