Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dsg4Q7TMD7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dsg4Q7TMD7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dsg4Q7TMD7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dsg4Q7TMD7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dsg4Q7TMD7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dsg4Q7TMD7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dsg4Q7TMD7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dsg4Q7TMD7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dsg4Q7TMD7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dsg4Q7TMD7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dsg4Q7TMD7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dsg4Q7TMD7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dsg4Q7TMD7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dsg4Q7TMD7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dsg4Q7TMD7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dsg4Q7TMD7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dsg4Q7TMD7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dsg4Q7TMD7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dsg4Q7TMD7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dsg4Q7TMD7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dsg4Q7TMD7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dsg4Q7TMD7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dsg4Q7TMD7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Dsg4Q7TMD7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Dsg4Q7TMD7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsg4Q7TMD7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsg4Q7TMD7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dsg4Q7TMD7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dsg4Q7TMD7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dsg4Q7TMD7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dsg4Q7TMD7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dsg4Q7TMD7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dsg4Q7TMD7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dsg4Q7TMD7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dsg4Q7TMD7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dsg4Q7TMD7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dsg4Q7TMD7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dsg4Q7TMD7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dsg4Q7TMD7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dsg4Q7TMD7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dsg4Q7TMD7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsg4Q7TMD7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsg4Q7TMD7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsg4Q7TMD7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsg4Q7TMD7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsg4Q7TMD7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsg4Q7TMD7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsg4Q7TMD7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsg4Q7TMD7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsg4Q7TMD7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsg4Q7TMD7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsg4Q7TMD7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dsg4Q7TMD7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dsg4Q7TMD7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dsg4Q7TMD7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dsg4Q7TMD7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dsg4Q7TMD7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dsg4Q7TMD7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dsg4Q7TMD7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dsg4Q7TMD7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dsg4Q7TMD7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dsg4Q7TMD7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dsg4Q7TMD7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dsg4Q7TMD7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dsg4Q7TMD7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dsg4Q7TMD7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dsg4Q7TMD7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dsg4Q7TMD7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dsg4Q7TMD7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsg4Q7TMD7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsg4Q7TMD7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsg4Q7TMD7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsg4Q7TMD7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dsg4Q7TMD7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dsg4Q7TMD7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dsg4Q7TMD7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dsg4Q7TMD7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dsg4Q7TMD7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dsg4Q7TMD7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dsg4Q7TMD7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dsg4Q7TMD7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dsg4Q7TMD7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dsg4Q7TMD7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dsg4Q7TMD7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dsg4Q7TMD7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dsg4Q7TMD7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dsg4Q7TMD7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dsg4Q7TMD7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dsg4Q7TMD7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dsg4Q7TMD7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dsg4Q7TMD7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Dsg4Q7TMD7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dsg4Q7TMD7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dsg4Q7TMD7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dsg4Q7TMD7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dsg4Q7TMD7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dsg4Q7TMD7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dsg4Q7TMD7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dsg4Q7TMD7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms