Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bnip1Q6QD59 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bnip1Q6QD59 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bnip1Q6QD59 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bnip1Q6QD59 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bnip1Q6QD59 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bnip1Q6QD59 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bnip1Q6QD59 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bnip1Q6QD59 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bnip1Q6QD59 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bnip1Q6QD59 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bnip1Q6QD59 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bnip1Q6QD59 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bnip1Q6QD59 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bnip1Q6QD59 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Bnip1Q6QD59 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Bnip1Q6QD59 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Bnip1Q6QD59 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bnip1Q6QD59 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bnip1Q6QD59 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bnip1Q6QD59 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bnip1Q6QD59 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bnip1Q6QD59 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bnip1Q6QD59 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bnip1Q6QD59 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bnip1Q6QD59 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bnip1Q6QD59 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bnip1Q6QD59 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bnip1Q6QD59 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bnip1Q6QD59 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bnip1Q6QD59 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bnip1Q6QD59 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bnip1Q6QD59 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bnip1Q6QD59 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bnip1Q6QD59 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bnip1Q6QD59 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bnip1Q6QD59 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bnip1Q6QD59 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bnip1Q6QD59 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bnip1Q6QD59 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bnip1Q6QD59 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bnip1Q6QD59 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bnip1Q6QD59 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bnip1Q6QD59 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bnip1Q6QD59 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bnip1Q6QD59 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bnip1Q6QD59 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bnip1Q6QD59 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bnip1Q6QD59 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bnip1Q6QD59 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bnip1Q6QD59 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bnip1Q6QD59 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bnip1Q6QD59 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bnip1Q6QD59 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bnip1Q6QD59 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bnip1Q6QD59 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bnip1Q6QD59 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Bnip1Q6QD59 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bnip1Q6QD59 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bnip1Q6QD59 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bnip1Q6QD59 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bnip1Q6QD59 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bnip1Q6QD59 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bnip1Q6QD59 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bnip1Q6QD59 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bnip1Q6QD59 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Bnip1Q6QD59 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bnip1Q6QD59 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bnip1Q6QD59 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bnip1Q6QD59 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bnip1Q6QD59 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bnip1Q6QD59 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bnip1Q6QD59 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bnip1Q6QD59 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bnip1Q6QD59 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bnip1Q6QD59 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bnip1Q6QD59 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bnip1Q6QD59 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bnip1Q6QD59 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bnip1Q6QD59 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bnip1Q6QD59 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bnip1Q6QD59 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bnip1Q6QD59 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bnip1Q6QD59 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bnip1Q6QD59 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bnip1Q6QD59 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bnip1Q6QD59 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bnip1Q6QD59 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bnip1Q6QD59 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bnip1Q6QD59 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bnip1Q6QD59 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bnip1Q6QD59 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bnip1Q6QD59 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bnip1Q6QD59 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bnip1Q6QD59 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Bnip1Q6QD59 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Bnip1Q6QD59 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bnip1Q6QD59 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bnip1Q6QD59 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bnip1Q6QD59 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms