Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY8

Trim45, Tripartite motif-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim45Q6PFY8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim45Q6PFY8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim45Q6PFY8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim45Q6PFY8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim45Q6PFY8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim45Q6PFY8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim45Q6PFY8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim45Q6PFY8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim45Q6PFY8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim45Q6PFY8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim45Q6PFY8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim45Q6PFY8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim45Q6PFY8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim45Q6PFY8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim45Q6PFY8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim45Q6PFY8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim45Q6PFY8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim45Q6PFY8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim45Q6PFY8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim45Q6PFY8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim45Q6PFY8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim45Q6PFY8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim45Q6PFY8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim45Q6PFY8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim45Q6PFY8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim45Q6PFY8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim45Q6PFY8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim45Q6PFY8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim45Q6PFY8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim45Q6PFY8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim45Q6PFY8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim45Q6PFY8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim45Q6PFY8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim45Q6PFY8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim45Q6PFY8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim45Q6PFY8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim45Q6PFY8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim45Q6PFY8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim45Q6PFY8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim45Q6PFY8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim45Q6PFY8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim45Q6PFY8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim45Q6PFY8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim45Q6PFY8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim45Q6PFY8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim45Q6PFY8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim45Q6PFY8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim45Q6PFY8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim45Q6PFY8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim45Q6PFY8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim45Q6PFY8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim45Q6PFY8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim45Q6PFY8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim45Q6PFY8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim45Q6PFY8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim45Q6PFY8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim45Q6PFY8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim45Q6PFY8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim45Q6PFY8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim45Q6PFY8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim45Q6PFY8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim45Q6PFY8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim45Q6PFY8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim45Q6PFY8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim45Q6PFY8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim45Q6PFY8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim45Q6PFY8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim45Q6PFY8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim45Q6PFY8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim45Q6PFY8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim45Q6PFY8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim45Q6PFY8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim45Q6PFY8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim45Q6PFY8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim45Q6PFY8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim45Q6PFY8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim45Q6PFY8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim45Q6PFY8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim45Q6PFY8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim45Q6PFY8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim45Q6PFY8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim45Q6PFY8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim45Q6PFY8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim45Q6PFY8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim45Q6PFY8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim45Q6PFY8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim45Q6PFY8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim45Q6PFY8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim45Q6PFY8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim45Q6PFY8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim45Q6PFY8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim45Q6PFY8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim45Q6PFY8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim45Q6PFY8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim45Q6PFY8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim45Q6PFY8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim45Q6PFY8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim45Q6PFY8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim45Q6PFY8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim45Q6PFY8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms