Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BC061212Q6P8K3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BC061212Q6P8K3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BC061212Q6P8K3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BC061212Q6P8K3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BC061212Q6P8K3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BC061212Q6P8K3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BC061212Q6P8K3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BC061212Q6P8K3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BC061212Q6P8K3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BC061212Q6P8K3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC061212Q6P8K3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC061212Q6P8K3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BC061212Q6P8K3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BC061212Q6P8K3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BC061212Q6P8K3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BC061212Q6P8K3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BC061212Q6P8K3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BC061212Q6P8K3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC061212Q6P8K3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC061212Q6P8K3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC061212Q6P8K3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC061212Q6P8K3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BC061212Q6P8K3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BC061212Q6P8K3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC061212Q6P8K3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC061212Q6P8K3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC061212Q6P8K3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BC061212Q6P8K3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BC061212Q6P8K3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BC061212Q6P8K3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BC061212Q6P8K3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BC061212Q6P8K3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BC061212Q6P8K3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BC061212Q6P8K3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BC061212Q6P8K3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BC061212Q6P8K3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BC061212Q6P8K3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BC061212Q6P8K3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BC061212Q6P8K3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BC061212Q6P8K3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BC061212Q6P8K3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BC061212Q6P8K3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BC061212Q6P8K3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BC061212Q6P8K3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BC061212Q6P8K3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC061212Q6P8K3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC061212Q6P8K3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC061212Q6P8K3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC061212Q6P8K3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC061212Q6P8K3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC061212Q6P8K3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BC061212Q6P8K3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC061212Q6P8K3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC061212Q6P8K3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC061212Q6P8K3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BC061212Q6P8K3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BC061212Q6P8K3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BC061212Q6P8K3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BC061212Q6P8K3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BC061212Q6P8K3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BC061212Q6P8K3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BC061212Q6P8K3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BC061212Q6P8K3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BC061212Q6P8K3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BC061212Q6P8K3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.3■■□□□ 1
BC061212Q6P8K3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BC061212Q6P8K3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BC061212Q6P8K3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BC061212Q6P8K3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BC061212Q6P8K3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BC061212Q6P8K3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BC061212Q6P8K3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BC061212Q6P8K3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BC061212Q6P8K3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BC061212Q6P8K3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BC061212Q6P8K3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BC061212Q6P8K3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BC061212Q6P8K3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BC061212Q6P8K3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BC061212Q6P8K3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BC061212Q6P8K3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BC061212Q6P8K3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BC061212Q6P8K3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BC061212Q6P8K3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC061212Q6P8K3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC061212Q6P8K3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BC061212Q6P8K3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC061212Q6P8K3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC061212Q6P8K3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC061212Q6P8K3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC061212Q6P8K3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC061212Q6P8K3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC061212Q6P8K3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC061212Q6P8K3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC061212Q6P8K3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC061212Q6P8K3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC061212Q6P8K3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC061212Q6P8K3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC061212Q6P8K3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.7 ms