Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cntn4Q69Z26 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cntn4Q69Z26 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cntn4Q69Z26 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cntn4Q69Z26 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cntn4Q69Z26 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cntn4Q69Z26 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cntn4Q69Z26 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cntn4Q69Z26 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cntn4Q69Z26 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cntn4Q69Z26 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cntn4Q69Z26 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cntn4Q69Z26 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cntn4Q69Z26 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cntn4Q69Z26 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cntn4Q69Z26 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cntn4Q69Z26 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cntn4Q69Z26 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntn4Q69Z26 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cntn4Q69Z26 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cntn4Q69Z26 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cntn4Q69Z26 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cntn4Q69Z26 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cntn4Q69Z26 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cntn4Q69Z26 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cntn4Q69Z26 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cntn4Q69Z26 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cntn4Q69Z26 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cntn4Q69Z26 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cntn4Q69Z26 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cntn4Q69Z26 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cntn4Q69Z26 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cntn4Q69Z26 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cntn4Q69Z26 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cntn4Q69Z26 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntn4Q69Z26 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntn4Q69Z26 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntn4Q69Z26 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntn4Q69Z26 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntn4Q69Z26 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntn4Q69Z26 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntn4Q69Z26 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntn4Q69Z26 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cntn4Q69Z26 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cntn4Q69Z26 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cntn4Q69Z26 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cntn4Q69Z26 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cntn4Q69Z26 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cntn4Q69Z26 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cntn4Q69Z26 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cntn4Q69Z26 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntn4Q69Z26 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntn4Q69Z26 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntn4Q69Z26 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntn4Q69Z26 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cntn4Q69Z26 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cntn4Q69Z26 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cntn4Q69Z26 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cntn4Q69Z26 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntn4Q69Z26 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntn4Q69Z26 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntn4Q69Z26 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntn4Q69Z26 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cntn4Q69Z26 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cntn4Q69Z26 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cntn4Q69Z26 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cntn4Q69Z26 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntn4Q69Z26 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntn4Q69Z26 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntn4Q69Z26 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntn4Q69Z26 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntn4Q69Z26 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntn4Q69Z26 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntn4Q69Z26 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntn4Q69Z26 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cntn4Q69Z26 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cntn4Q69Z26 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntn4Q69Z26 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntn4Q69Z26 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cntn4Q69Z26 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cntn4Q69Z26 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cntn4Q69Z26 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cntn4Q69Z26 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cntn4Q69Z26 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cntn4Q69Z26 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cntn4Q69Z26 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cntn4Q69Z26 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cntn4Q69Z26 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cntn4Q69Z26 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cntn4Q69Z26 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cntn4Q69Z26 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cntn4Q69Z26 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntn4Q69Z26 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntn4Q69Z26 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntn4Q69Z26 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cntn4Q69Z26 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cntn4Q69Z26 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cntn4Q69Z26 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cntn4Q69Z26 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cntn4Q69Z26 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms