Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CcncQ62447 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CcncQ62447 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CcncQ62447 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CcncQ62447 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CcncQ62447 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CcncQ62447 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CcncQ62447 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CcncQ62447 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CcncQ62447 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CcncQ62447 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CcncQ62447 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CcncQ62447 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CcncQ62447 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CcncQ62447 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CcncQ62447 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CcncQ62447 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CcncQ62447 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CcncQ62447 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CcncQ62447 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CcncQ62447 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CcncQ62447 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CcncQ62447 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CcncQ62447 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CcncQ62447 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CcncQ62447 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CcncQ62447 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CcncQ62447 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CcncQ62447 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CcncQ62447 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CcncQ62447 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CcncQ62447 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CcncQ62447 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CcncQ62447 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CcncQ62447 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CcncQ62447 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CcncQ62447 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CcncQ62447 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CcncQ62447 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CcncQ62447 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CcncQ62447 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CcncQ62447 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CcncQ62447 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CcncQ62447 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CcncQ62447 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CcncQ62447 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CcncQ62447 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CcncQ62447 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CcncQ62447 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CcncQ62447 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CcncQ62447 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CcncQ62447 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CcncQ62447 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CcncQ62447 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CcncQ62447 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CcncQ62447 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CcncQ62447 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CcncQ62447 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CcncQ62447 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CcncQ62447 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CcncQ62447 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CcncQ62447 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CcncQ62447 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CcncQ62447 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CcncQ62447 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CcncQ62447 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CcncQ62447 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CcncQ62447 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CcncQ62447 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CcncQ62447 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CcncQ62447 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CcncQ62447 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CcncQ62447 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CcncQ62447 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CcncQ62447 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CcncQ62447 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CcncQ62447 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CcncQ62447 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CcncQ62447 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CcncQ62447 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CcncQ62447 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CcncQ62447 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CcncQ62447 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CcncQ62447 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CcncQ62447 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CcncQ62447 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CcncQ62447 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CcncQ62447 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CcncQ62447 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CcncQ62447 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CcncQ62447 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CcncQ62447 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CcncQ62447 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CcncQ62447 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CcncQ62447 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CcncQ62447 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CcncQ62447 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CcncQ62447 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CcncQ62447 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CcncQ62447 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms