Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Itga7Q61738 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itga7Q61738 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itga7Q61738 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itga7Q61738 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itga7Q61738 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itga7Q61738 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itga7Q61738 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itga7Q61738 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itga7Q61738 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itga7Q61738 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itga7Q61738 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Itga7Q61738 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itga7Q61738 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itga7Q61738 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itga7Q61738 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itga7Q61738 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itga7Q61738 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itga7Q61738 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itga7Q61738 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itga7Q61738 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itga7Q61738 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itga7Q61738 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itga7Q61738 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itga7Q61738 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Itga7Q61738 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itga7Q61738 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itga7Q61738 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itga7Q61738 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itga7Q61738 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itga7Q61738 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itga7Q61738 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itga7Q61738 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itga7Q61738 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itga7Q61738 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itga7Q61738 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itga7Q61738 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itga7Q61738 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itga7Q61738 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itga7Q61738 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itga7Q61738 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itga7Q61738 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itga7Q61738 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itga7Q61738 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itga7Q61738 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itga7Q61738 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itga7Q61738 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itga7Q61738 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itga7Q61738 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itga7Q61738 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itga7Q61738 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itga7Q61738 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itga7Q61738 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Itga7Q61738 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itga7Q61738 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itga7Q61738 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itga7Q61738 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itga7Q61738 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itga7Q61738 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itga7Q61738 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itga7Q61738 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itga7Q61738 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itga7Q61738 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itga7Q61738 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itga7Q61738 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itga7Q61738 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itga7Q61738 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itga7Q61738 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itga7Q61738 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itga7Q61738 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Itga7Q61738 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itga7Q61738 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itga7Q61738 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itga7Q61738 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itga7Q61738 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itga7Q61738 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itga7Q61738 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itga7Q61738 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Itga7Q61738 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itga7Q61738 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itga7Q61738 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Itga7Q61738 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itga7Q61738 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itga7Q61738 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itga7Q61738 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itga7Q61738 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itga7Q61738 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itga7Q61738 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itga7Q61738 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itga7Q61738 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itga7Q61738 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itga7Q61738 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itga7Q61738 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itga7Q61738 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itga7Q61738 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Itga7Q61738 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itga7Q61738 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itga7Q61738 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itga7Q61738 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Itga7Q61738 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms