Protein–RNA interactions for Protein: Q61169

Gata6, Transcription factor GATA-6, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata6Q61169 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gata6Q61169 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gata6Q61169 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gata6Q61169 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gata6Q61169 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gata6Q61169 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gata6Q61169 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gata6Q61169 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gata6Q61169 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gata6Q61169 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gata6Q61169 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gata6Q61169 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gata6Q61169 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gata6Q61169 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gata6Q61169 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gata6Q61169 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gata6Q61169 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gata6Q61169 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gata6Q61169 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gata6Q61169 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gata6Q61169 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gata6Q61169 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gata6Q61169 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gata6Q61169 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gata6Q61169 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gata6Q61169 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gata6Q61169 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gata6Q61169 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gata6Q61169 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gata6Q61169 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gata6Q61169 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gata6Q61169 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gata6Q61169 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gata6Q61169 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gata6Q61169 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gata6Q61169 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gata6Q61169 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gata6Q61169 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gata6Q61169 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gata6Q61169 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gata6Q61169 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gata6Q61169 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gata6Q61169 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gata6Q61169 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gata6Q61169 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gata6Q61169 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gata6Q61169 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gata6Q61169 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gata6Q61169 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gata6Q61169 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gata6Q61169 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gata6Q61169 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gata6Q61169 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gata6Q61169 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gata6Q61169 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gata6Q61169 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gata6Q61169 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gata6Q61169 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gata6Q61169 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gata6Q61169 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gata6Q61169 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gata6Q61169 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gata6Q61169 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gata6Q61169 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gata6Q61169 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gata6Q61169 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gata6Q61169 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gata6Q61169 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gata6Q61169 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gata6Q61169 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gata6Q61169 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gata6Q61169 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gata6Q61169 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gata6Q61169 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gata6Q61169 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gata6Q61169 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gata6Q61169 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gata6Q61169 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gata6Q61169 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gata6Q61169 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gata6Q61169 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gata6Q61169 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gata6Q61169 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gata6Q61169 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gata6Q61169 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gata6Q61169 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gata6Q61169 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gata6Q61169 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gata6Q61169 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gata6Q61169 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gata6Q61169 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gata6Q61169 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gata6Q61169 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gata6Q61169 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gata6Q61169 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gata6Q61169 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gata6Q61169 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gata6Q61169 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gata6Q61169 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gata6Q61169 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms