Protein–RNA interactions for Protein: Q61146

Ocln, Occludin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OclnQ61146 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OclnQ61146 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OclnQ61146 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OclnQ61146 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OclnQ61146 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OclnQ61146 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OclnQ61146 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OclnQ61146 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OclnQ61146 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OclnQ61146 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
OclnQ61146 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
OclnQ61146 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
OclnQ61146 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OclnQ61146 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OclnQ61146 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OclnQ61146 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OclnQ61146 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OclnQ61146 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OclnQ61146 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OclnQ61146 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OclnQ61146 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OclnQ61146 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OclnQ61146 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
OclnQ61146 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OclnQ61146 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
OclnQ61146 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OclnQ61146 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OclnQ61146 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OclnQ61146 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OclnQ61146 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OclnQ61146 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OclnQ61146 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OclnQ61146 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OclnQ61146 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OclnQ61146 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OclnQ61146 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OclnQ61146 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OclnQ61146 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OclnQ61146 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OclnQ61146 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OclnQ61146 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OclnQ61146 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OclnQ61146 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OclnQ61146 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OclnQ61146 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OclnQ61146 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OclnQ61146 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OclnQ61146 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OclnQ61146 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OclnQ61146 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OclnQ61146 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OclnQ61146 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OclnQ61146 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OclnQ61146 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OclnQ61146 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OclnQ61146 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OclnQ61146 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OclnQ61146 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OclnQ61146 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OclnQ61146 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OclnQ61146 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OclnQ61146 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OclnQ61146 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OclnQ61146 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OclnQ61146 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OclnQ61146 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OclnQ61146 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OclnQ61146 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OclnQ61146 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OclnQ61146 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OclnQ61146 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OclnQ61146 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OclnQ61146 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OclnQ61146 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OclnQ61146 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OclnQ61146 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OclnQ61146 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OclnQ61146 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OclnQ61146 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OclnQ61146 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
OclnQ61146 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OclnQ61146 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OclnQ61146 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OclnQ61146 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OclnQ61146 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OclnQ61146 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OclnQ61146 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OclnQ61146 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OclnQ61146 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OclnQ61146 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OclnQ61146 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OclnQ61146 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OclnQ61146 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OclnQ61146 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OclnQ61146 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OclnQ61146 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OclnQ61146 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OclnQ61146 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OclnQ61146 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OclnQ61146 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms