Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctf1Q60753 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctf1Q60753 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctf1Q60753 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctf1Q60753 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctf1Q60753 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctf1Q60753 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ctf1Q60753 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ctf1Q60753 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctf1Q60753 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctf1Q60753 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctf1Q60753 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctf1Q60753 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctf1Q60753 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctf1Q60753 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctf1Q60753 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctf1Q60753 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctf1Q60753 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctf1Q60753 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctf1Q60753 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctf1Q60753 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctf1Q60753 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctf1Q60753 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctf1Q60753 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctf1Q60753 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctf1Q60753 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctf1Q60753 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctf1Q60753 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctf1Q60753 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctf1Q60753 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctf1Q60753 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctf1Q60753 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctf1Q60753 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctf1Q60753 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctf1Q60753 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctf1Q60753 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctf1Q60753 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctf1Q60753 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctf1Q60753 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctf1Q60753 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctf1Q60753 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctf1Q60753 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctf1Q60753 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctf1Q60753 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctf1Q60753 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctf1Q60753 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctf1Q60753 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctf1Q60753 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctf1Q60753 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctf1Q60753 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctf1Q60753 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctf1Q60753 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctf1Q60753 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctf1Q60753 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctf1Q60753 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctf1Q60753 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctf1Q60753 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctf1Q60753 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctf1Q60753 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctf1Q60753 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctf1Q60753 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctf1Q60753 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctf1Q60753 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctf1Q60753 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctf1Q60753 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctf1Q60753 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctf1Q60753 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ctf1Q60753 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctf1Q60753 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctf1Q60753 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctf1Q60753 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctf1Q60753 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctf1Q60753 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctf1Q60753 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctf1Q60753 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctf1Q60753 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctf1Q60753 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctf1Q60753 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctf1Q60753 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctf1Q60753 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctf1Q60753 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctf1Q60753 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctf1Q60753 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctf1Q60753 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctf1Q60753 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctf1Q60753 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctf1Q60753 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctf1Q60753 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctf1Q60753 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctf1Q60753 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctf1Q60753 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctf1Q60753 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctf1Q60753 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctf1Q60753 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctf1Q60753 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctf1Q60753 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctf1Q60753 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctf1Q60753 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctf1Q60753 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctf1Q60753 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 239.5 ms