Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D9

Thoc6, THO complex subunit 6 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc6Q5U4D9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Thoc6Q5U4D9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Thoc6Q5U4D9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Thoc6Q5U4D9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thoc6Q5U4D9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thoc6Q5U4D9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thoc6Q5U4D9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thoc6Q5U4D9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thoc6Q5U4D9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thoc6Q5U4D9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thoc6Q5U4D9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Thoc6Q5U4D9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Thoc6Q5U4D9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Thoc6Q5U4D9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Thoc6Q5U4D9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Thoc6Q5U4D9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Thoc6Q5U4D9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Thoc6Q5U4D9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Thoc6Q5U4D9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Thoc6Q5U4D9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Thoc6Q5U4D9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Thoc6Q5U4D9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Thoc6Q5U4D9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Thoc6Q5U4D9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Thoc6Q5U4D9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Thoc6Q5U4D9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Thoc6Q5U4D9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Thoc6Q5U4D9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Thoc6Q5U4D9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Thoc6Q5U4D9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Thoc6Q5U4D9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Thoc6Q5U4D9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Thoc6Q5U4D9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Thoc6Q5U4D9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Thoc6Q5U4D9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Thoc6Q5U4D9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Thoc6Q5U4D9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Thoc6Q5U4D9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Thoc6Q5U4D9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Thoc6Q5U4D9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Thoc6Q5U4D9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Thoc6Q5U4D9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Thoc6Q5U4D9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Thoc6Q5U4D9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Thoc6Q5U4D9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Thoc6Q5U4D9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Thoc6Q5U4D9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Thoc6Q5U4D9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Thoc6Q5U4D9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Thoc6Q5U4D9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Thoc6Q5U4D9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Thoc6Q5U4D9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Thoc6Q5U4D9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Thoc6Q5U4D9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Thoc6Q5U4D9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Thoc6Q5U4D9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Thoc6Q5U4D9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Thoc6Q5U4D9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Thoc6Q5U4D9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Thoc6Q5U4D9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Thoc6Q5U4D9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thoc6Q5U4D9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thoc6Q5U4D9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thoc6Q5U4D9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thoc6Q5U4D9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thoc6Q5U4D9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thoc6Q5U4D9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thoc6Q5U4D9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thoc6Q5U4D9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thoc6Q5U4D9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Thoc6Q5U4D9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Thoc6Q5U4D9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Thoc6Q5U4D9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Thoc6Q5U4D9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thoc6Q5U4D9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thoc6Q5U4D9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thoc6Q5U4D9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Thoc6Q5U4D9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Thoc6Q5U4D9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Thoc6Q5U4D9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Thoc6Q5U4D9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Thoc6Q5U4D9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Thoc6Q5U4D9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Thoc6Q5U4D9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Thoc6Q5U4D9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Thoc6Q5U4D9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Thoc6Q5U4D9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Thoc6Q5U4D9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Thoc6Q5U4D9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Thoc6Q5U4D9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Thoc6Q5U4D9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Thoc6Q5U4D9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Thoc6Q5U4D9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Thoc6Q5U4D9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Thoc6Q5U4D9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Thoc6Q5U4D9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Thoc6Q5U4D9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Thoc6Q5U4D9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Thoc6Q5U4D9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Thoc6Q5U4D9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms