Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r196Q5SVD5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r196Q5SVD5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r196Q5SVD5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vmn1r196Q5SVD5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vmn1r196Q5SVD5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vmn1r196Q5SVD5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r196Q5SVD5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r196Q5SVD5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r196Q5SVD5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r196Q5SVD5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r196Q5SVD5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r196Q5SVD5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r196Q5SVD5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r196Q5SVD5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r196Q5SVD5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r196Q5SVD5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r196Q5SVD5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r196Q5SVD5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r196Q5SVD5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r196Q5SVD5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r196Q5SVD5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r196Q5SVD5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r196Q5SVD5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r196Q5SVD5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r196Q5SVD5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r196Q5SVD5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r196Q5SVD5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r196Q5SVD5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r196Q5SVD5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r196Q5SVD5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r196Q5SVD5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r196Q5SVD5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r196Q5SVD5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Vmn1r196Q5SVD5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r196Q5SVD5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r196Q5SVD5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r196Q5SVD5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r196Q5SVD5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r196Q5SVD5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r196Q5SVD5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r196Q5SVD5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r196Q5SVD5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r196Q5SVD5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r196Q5SVD5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r196Q5SVD5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r196Q5SVD5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r196Q5SVD5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Vmn1r196Q5SVD5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r196Q5SVD5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r196Q5SVD5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r196Q5SVD5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r196Q5SVD5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r196Q5SVD5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r196Q5SVD5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r196Q5SVD5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r196Q5SVD5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r196Q5SVD5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r196Q5SVD5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r196Q5SVD5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r196Q5SVD5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r196Q5SVD5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r196Q5SVD5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r196Q5SVD5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r196Q5SVD5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r196Q5SVD5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r196Q5SVD5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r196Q5SVD5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r196Q5SVD5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r196Q5SVD5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r196Q5SVD5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r196Q5SVD5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r196Q5SVD5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r196Q5SVD5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r196Q5SVD5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r196Q5SVD5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r196Q5SVD5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r196Q5SVD5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r196Q5SVD5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r196Q5SVD5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r196Q5SVD5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r196Q5SVD5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r196Q5SVD5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r196Q5SVD5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r196Q5SVD5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r196Q5SVD5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r196Q5SVD5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r196Q5SVD5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r196Q5SVD5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r196Q5SVD5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r196Q5SVD5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r196Q5SVD5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r196Q5SVD5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r196Q5SVD5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r196Q5SVD5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms