Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bbs12Q5SUD9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bbs12Q5SUD9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bbs12Q5SUD9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bbs12Q5SUD9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bbs12Q5SUD9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bbs12Q5SUD9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bbs12Q5SUD9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bbs12Q5SUD9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bbs12Q5SUD9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bbs12Q5SUD9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bbs12Q5SUD9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bbs12Q5SUD9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bbs12Q5SUD9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bbs12Q5SUD9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Bbs12Q5SUD9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Bbs12Q5SUD9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Bbs12Q5SUD9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bbs12Q5SUD9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bbs12Q5SUD9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bbs12Q5SUD9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bbs12Q5SUD9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bbs12Q5SUD9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bbs12Q5SUD9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bbs12Q5SUD9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bbs12Q5SUD9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bbs12Q5SUD9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bbs12Q5SUD9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bbs12Q5SUD9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bbs12Q5SUD9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bbs12Q5SUD9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bbs12Q5SUD9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bbs12Q5SUD9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bbs12Q5SUD9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bbs12Q5SUD9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bbs12Q5SUD9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bbs12Q5SUD9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bbs12Q5SUD9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bbs12Q5SUD9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bbs12Q5SUD9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bbs12Q5SUD9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bbs12Q5SUD9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Bbs12Q5SUD9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bbs12Q5SUD9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bbs12Q5SUD9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bbs12Q5SUD9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bbs12Q5SUD9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Bbs12Q5SUD9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Bbs12Q5SUD9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Bbs12Q5SUD9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Bbs12Q5SUD9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bbs12Q5SUD9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Bbs12Q5SUD9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bbs12Q5SUD9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bbs12Q5SUD9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bbs12Q5SUD9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Bbs12Q5SUD9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Bbs12Q5SUD9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bbs12Q5SUD9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bbs12Q5SUD9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bbs12Q5SUD9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bbs12Q5SUD9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bbs12Q5SUD9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bbs12Q5SUD9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bbs12Q5SUD9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bbs12Q5SUD9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bbs12Q5SUD9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bbs12Q5SUD9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bbs12Q5SUD9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Bbs12Q5SUD9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bbs12Q5SUD9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bbs12Q5SUD9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bbs12Q5SUD9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bbs12Q5SUD9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bbs12Q5SUD9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bbs12Q5SUD9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bbs12Q5SUD9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bbs12Q5SUD9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bbs12Q5SUD9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bbs12Q5SUD9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bbs12Q5SUD9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bbs12Q5SUD9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bbs12Q5SUD9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bbs12Q5SUD9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bbs12Q5SUD9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bbs12Q5SUD9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bbs12Q5SUD9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bbs12Q5SUD9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Bbs12Q5SUD9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bbs12Q5SUD9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bbs12Q5SUD9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Bbs12Q5SUD9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bbs12Q5SUD9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bbs12Q5SUD9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bbs12Q5SUD9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bbs12Q5SUD9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bbs12Q5SUD9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Bbs12Q5SUD9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Bbs12Q5SUD9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bbs12Q5SUD9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms