Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIN52Q52LA3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIN52Q52LA3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIN52Q52LA3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIN52Q52LA3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIN52Q52LA3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIN52Q52LA3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIN52Q52LA3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIN52Q52LA3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIN52Q52LA3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIN52Q52LA3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIN52Q52LA3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIN52Q52LA3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIN52Q52LA3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LIN52Q52LA3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIN52Q52LA3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIN52Q52LA3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIN52Q52LA3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIN52Q52LA3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LIN52Q52LA3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIN52Q52LA3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIN52Q52LA3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIN52Q52LA3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIN52Q52LA3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIN52Q52LA3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIN52Q52LA3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIN52Q52LA3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIN52Q52LA3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIN52Q52LA3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIN52Q52LA3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIN52Q52LA3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIN52Q52LA3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIN52Q52LA3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIN52Q52LA3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIN52Q52LA3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIN52Q52LA3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIN52Q52LA3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LIN52Q52LA3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIN52Q52LA3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIN52Q52LA3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIN52Q52LA3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIN52Q52LA3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIN52Q52LA3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIN52Q52LA3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIN52Q52LA3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIN52Q52LA3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIN52Q52LA3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIN52Q52LA3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIN52Q52LA3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIN52Q52LA3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIN52Q52LA3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIN52Q52LA3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LIN52Q52LA3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LIN52Q52LA3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LIN52Q52LA3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LIN52Q52LA3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIN52Q52LA3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIN52Q52LA3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIN52Q52LA3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIN52Q52LA3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIN52Q52LA3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIN52Q52LA3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIN52Q52LA3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIN52Q52LA3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIN52Q52LA3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIN52Q52LA3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIN52Q52LA3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIN52Q52LA3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIN52Q52LA3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN52Q52LA3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN52Q52LA3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN52Q52LA3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN52Q52LA3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN52Q52LA3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIN52Q52LA3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIN52Q52LA3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIN52Q52LA3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIN52Q52LA3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIN52Q52LA3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LIN52Q52LA3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIN52Q52LA3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIN52Q52LA3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIN52Q52LA3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIN52Q52LA3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIN52Q52LA3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIN52Q52LA3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIN52Q52LA3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIN52Q52LA3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIN52Q52LA3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIN52Q52LA3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LIN52Q52LA3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LIN52Q52LA3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LIN52Q52LA3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIN52Q52LA3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIN52Q52LA3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIN52Q52LA3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LIN52Q52LA3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LIN52Q52LA3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LIN52Q52LA3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LIN52Q52LA3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms