Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q3V0E1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q3V0E1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Q3V0E1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q3V0E1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q3V0E1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q3V0E1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q3V0E1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Q3V0E1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q3V0E1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q3V0E1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q3V0E1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q3V0E1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q3V0E1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q3V0E1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q3V0E1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Q3V0E1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q3V0E1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Q3V0E1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q3V0E1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q3V0E1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q3V0E1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q3V0E1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q3V0E1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Q3V0E1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q3V0E1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q3V0E1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q3V0E1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q3V0E1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q3V0E1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q3V0E1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q3V0E1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q3V0E1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q3V0E1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q3V0E1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q3V0E1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q3V0E1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q3V0E1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q3V0E1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q3V0E1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q3V0E1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q3V0E1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q3V0E1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q3V0E1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q3V0E1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q3V0E1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q3V0E1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q3V0E1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q3V0E1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q3V0E1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q3V0E1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q3V0E1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q3V0E1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Q3V0E1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3V0E1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3V0E1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3V0E1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3V0E1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q3V0E1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q3V0E1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q3V0E1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q3V0E1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q3V0E1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q3V0E1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q3V0E1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q3V0E1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q3V0E1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q3V0E1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3V0E1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3V0E1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q3V0E1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q3V0E1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q3V0E1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q3V0E1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q3V0E1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q3V0E1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q3V0E1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q3V0E1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q3V0E1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q3V0E1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q3V0E1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q3V0E1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q3V0E1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q3V0E1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q3V0E1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q3V0E1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q3V0E1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q3V0E1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Q3V0E1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Q3V0E1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q3V0E1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q3V0E1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q3V0E1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q3V0E1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q3V0E1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3V0E1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3V0E1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3V0E1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3V0E1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q3V0E1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms