Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C87499Q3UX49 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C87499Q3UX49 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C87499Q3UX49 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C87499Q3UX49 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C87499Q3UX49 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C87499Q3UX49 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C87499Q3UX49 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C87499Q3UX49 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C87499Q3UX49 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C87499Q3UX49 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C87499Q3UX49 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C87499Q3UX49 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
C87499Q3UX49 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C87499Q3UX49 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C87499Q3UX49 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C87499Q3UX49 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
C87499Q3UX49 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C87499Q3UX49 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
C87499Q3UX49 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C87499Q3UX49 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C87499Q3UX49 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C87499Q3UX49 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C87499Q3UX49 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
C87499Q3UX49 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C87499Q3UX49 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
C87499Q3UX49 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C87499Q3UX49 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C87499Q3UX49 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C87499Q3UX49 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C87499Q3UX49 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C87499Q3UX49 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C87499Q3UX49 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C87499Q3UX49 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C87499Q3UX49 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C87499Q3UX49 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C87499Q3UX49 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C87499Q3UX49 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C87499Q3UX49 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C87499Q3UX49 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C87499Q3UX49 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C87499Q3UX49 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C87499Q3UX49 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C87499Q3UX49 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
C87499Q3UX49 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C87499Q3UX49 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C87499Q3UX49 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C87499Q3UX49 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C87499Q3UX49 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C87499Q3UX49 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C87499Q3UX49 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
C87499Q3UX49 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
C87499Q3UX49 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
C87499Q3UX49 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C87499Q3UX49 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C87499Q3UX49 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
C87499Q3UX49 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C87499Q3UX49 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C87499Q3UX49 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
C87499Q3UX49 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C87499Q3UX49 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C87499Q3UX49 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C87499Q3UX49 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C87499Q3UX49 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C87499Q3UX49 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C87499Q3UX49 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C87499Q3UX49 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C87499Q3UX49 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C87499Q3UX49 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C87499Q3UX49 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C87499Q3UX49 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C87499Q3UX49 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C87499Q3UX49 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C87499Q3UX49 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
C87499Q3UX49 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C87499Q3UX49 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
C87499Q3UX49 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
C87499Q3UX49 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
C87499Q3UX49 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
C87499Q3UX49 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
C87499Q3UX49 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
C87499Q3UX49 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C87499Q3UX49 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C87499Q3UX49 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C87499Q3UX49 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C87499Q3UX49 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C87499Q3UX49 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C87499Q3UX49 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C87499Q3UX49 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C87499Q3UX49 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C87499Q3UX49 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C87499Q3UX49 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C87499Q3UX49 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C87499Q3UX49 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
C87499Q3UX49 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
C87499Q3UX49 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
C87499Q3UX49 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
C87499Q3UX49 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C87499Q3UX49 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C87499Q3UX49 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms