Protein–RNA interactions for Protein: Q3USF0

B3gnt6, Acetylgalactosaminyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3gnt6Q3USF0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B3gnt6Q3USF0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B3gnt6Q3USF0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B3gnt6Q3USF0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B3gnt6Q3USF0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B3gnt6Q3USF0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
B3gnt6Q3USF0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
B3gnt6Q3USF0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
B3gnt6Q3USF0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
B3gnt6Q3USF0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B3gnt6Q3USF0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B3gnt6Q3USF0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B3gnt6Q3USF0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B3gnt6Q3USF0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
B3gnt6Q3USF0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
B3gnt6Q3USF0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
B3gnt6Q3USF0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
B3gnt6Q3USF0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
B3gnt6Q3USF0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
B3gnt6Q3USF0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
B3gnt6Q3USF0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
B3gnt6Q3USF0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
B3gnt6Q3USF0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
B3gnt6Q3USF0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
B3gnt6Q3USF0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
B3gnt6Q3USF0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
B3gnt6Q3USF0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
B3gnt6Q3USF0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
B3gnt6Q3USF0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
B3gnt6Q3USF0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
B3gnt6Q3USF0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
B3gnt6Q3USF0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
B3gnt6Q3USF0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
B3gnt6Q3USF0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
B3gnt6Q3USF0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
B3gnt6Q3USF0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
B3gnt6Q3USF0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
B3gnt6Q3USF0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
B3gnt6Q3USF0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
B3gnt6Q3USF0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
B3gnt6Q3USF0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
B3gnt6Q3USF0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
B3gnt6Q3USF0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
B3gnt6Q3USF0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
B3gnt6Q3USF0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
B3gnt6Q3USF0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
B3gnt6Q3USF0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
B3gnt6Q3USF0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
B3gnt6Q3USF0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
B3gnt6Q3USF0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
B3gnt6Q3USF0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
B3gnt6Q3USF0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
B3gnt6Q3USF0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
B3gnt6Q3USF0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
B3gnt6Q3USF0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
B3gnt6Q3USF0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
B3gnt6Q3USF0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B3gnt6Q3USF0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B3gnt6Q3USF0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
B3gnt6Q3USF0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
B3gnt6Q3USF0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
B3gnt6Q3USF0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
B3gnt6Q3USF0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
B3gnt6Q3USF0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
B3gnt6Q3USF0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B3gnt6Q3USF0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B3gnt6Q3USF0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B3gnt6Q3USF0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
B3gnt6Q3USF0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
B3gnt6Q3USF0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B3gnt6Q3USF0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B3gnt6Q3USF0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B3gnt6Q3USF0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B3gnt6Q3USF0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B3gnt6Q3USF0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B3gnt6Q3USF0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
B3gnt6Q3USF0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
B3gnt6Q3USF0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
B3gnt6Q3USF0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
B3gnt6Q3USF0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
B3gnt6Q3USF0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
B3gnt6Q3USF0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
B3gnt6Q3USF0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
B3gnt6Q3USF0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
B3gnt6Q3USF0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
B3gnt6Q3USF0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
B3gnt6Q3USF0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
B3gnt6Q3USF0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
B3gnt6Q3USF0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
B3gnt6Q3USF0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
B3gnt6Q3USF0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
B3gnt6Q3USF0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
B3gnt6Q3USF0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
B3gnt6Q3USF0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
B3gnt6Q3USF0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
B3gnt6Q3USF0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
B3gnt6Q3USF0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
B3gnt6Q3USF0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
B3gnt6Q3USF0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
B3gnt6Q3USF0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms