Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR97

Snx21, Sorting nexin-21, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx21Q3UR97 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx21Q3UR97 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx21Q3UR97 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx21Q3UR97 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx21Q3UR97 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx21Q3UR97 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx21Q3UR97 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx21Q3UR97 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx21Q3UR97 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx21Q3UR97 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx21Q3UR97 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx21Q3UR97 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx21Q3UR97 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx21Q3UR97 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx21Q3UR97 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx21Q3UR97 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx21Q3UR97 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx21Q3UR97 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx21Q3UR97 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx21Q3UR97 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx21Q3UR97 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx21Q3UR97 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx21Q3UR97 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx21Q3UR97 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx21Q3UR97 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx21Q3UR97 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx21Q3UR97 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx21Q3UR97 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx21Q3UR97 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Snx21Q3UR97 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Snx21Q3UR97 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx21Q3UR97 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx21Q3UR97 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx21Q3UR97 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx21Q3UR97 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx21Q3UR97 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx21Q3UR97 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx21Q3UR97 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx21Q3UR97 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx21Q3UR97 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx21Q3UR97 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx21Q3UR97 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx21Q3UR97 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx21Q3UR97 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx21Q3UR97 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx21Q3UR97 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx21Q3UR97 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx21Q3UR97 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx21Q3UR97 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx21Q3UR97 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx21Q3UR97 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx21Q3UR97 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx21Q3UR97 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx21Q3UR97 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx21Q3UR97 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx21Q3UR97 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx21Q3UR97 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx21Q3UR97 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx21Q3UR97 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx21Q3UR97 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx21Q3UR97 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx21Q3UR97 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx21Q3UR97 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx21Q3UR97 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx21Q3UR97 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx21Q3UR97 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx21Q3UR97 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx21Q3UR97 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx21Q3UR97 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx21Q3UR97 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx21Q3UR97 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx21Q3UR97 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx21Q3UR97 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx21Q3UR97 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx21Q3UR97 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx21Q3UR97 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx21Q3UR97 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx21Q3UR97 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx21Q3UR97 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx21Q3UR97 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx21Q3UR97 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx21Q3UR97 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx21Q3UR97 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx21Q3UR97 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx21Q3UR97 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx21Q3UR97 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx21Q3UR97 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx21Q3UR97 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx21Q3UR97 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx21Q3UR97 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx21Q3UR97 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx21Q3UR97 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx21Q3UR97 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx21Q3UR97 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snx21Q3UR97 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snx21Q3UR97 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Snx21Q3UR97 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx21Q3UR97 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx21Q3UR97 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx21Q3UR97 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms