Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Shcbp1lQ3TTP0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shcbp1lQ3TTP0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shcbp1lQ3TTP0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shcbp1lQ3TTP0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shcbp1lQ3TTP0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shcbp1lQ3TTP0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shcbp1lQ3TTP0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shcbp1lQ3TTP0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shcbp1lQ3TTP0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Shcbp1lQ3TTP0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shcbp1lQ3TTP0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shcbp1lQ3TTP0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shcbp1lQ3TTP0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shcbp1lQ3TTP0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shcbp1lQ3TTP0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Shcbp1lQ3TTP0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Shcbp1lQ3TTP0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Shcbp1lQ3TTP0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shcbp1lQ3TTP0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shcbp1lQ3TTP0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Shcbp1lQ3TTP0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shcbp1lQ3TTP0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Shcbp1lQ3TTP0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shcbp1lQ3TTP0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shcbp1lQ3TTP0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shcbp1lQ3TTP0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shcbp1lQ3TTP0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shcbp1lQ3TTP0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shcbp1lQ3TTP0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shcbp1lQ3TTP0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shcbp1lQ3TTP0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shcbp1lQ3TTP0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shcbp1lQ3TTP0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shcbp1lQ3TTP0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shcbp1lQ3TTP0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shcbp1lQ3TTP0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shcbp1lQ3TTP0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shcbp1lQ3TTP0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shcbp1lQ3TTP0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shcbp1lQ3TTP0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shcbp1lQ3TTP0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shcbp1lQ3TTP0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shcbp1lQ3TTP0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shcbp1lQ3TTP0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shcbp1lQ3TTP0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Shcbp1lQ3TTP0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Shcbp1lQ3TTP0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shcbp1lQ3TTP0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shcbp1lQ3TTP0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shcbp1lQ3TTP0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shcbp1lQ3TTP0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Shcbp1lQ3TTP0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Shcbp1lQ3TTP0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Shcbp1lQ3TTP0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Shcbp1lQ3TTP0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Shcbp1lQ3TTP0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Shcbp1lQ3TTP0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Shcbp1lQ3TTP0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Shcbp1lQ3TTP0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Shcbp1lQ3TTP0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Shcbp1lQ3TTP0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Shcbp1lQ3TTP0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Shcbp1lQ3TTP0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Shcbp1lQ3TTP0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Shcbp1lQ3TTP0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Shcbp1lQ3TTP0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Shcbp1lQ3TTP0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Shcbp1lQ3TTP0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Shcbp1lQ3TTP0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Shcbp1lQ3TTP0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Shcbp1lQ3TTP0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Shcbp1lQ3TTP0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Shcbp1lQ3TTP0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Shcbp1lQ3TTP0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Shcbp1lQ3TTP0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Shcbp1lQ3TTP0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Shcbp1lQ3TTP0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Shcbp1lQ3TTP0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Shcbp1lQ3TTP0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Shcbp1lQ3TTP0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Shcbp1lQ3TTP0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
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