Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kcnma1Q08460 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kcnma1Q08460 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kcnma1Q08460 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kcnma1Q08460 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kcnma1Q08460 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kcnma1Q08460 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kcnma1Q08460 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kcnma1Q08460 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kcnma1Q08460 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kcnma1Q08460 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kcnma1Q08460 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kcnma1Q08460 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kcnma1Q08460 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kcnma1Q08460 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kcnma1Q08460 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kcnma1Q08460 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kcnma1Q08460 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kcnma1Q08460 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kcnma1Q08460 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kcnma1Q08460 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kcnma1Q08460 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Kcnma1Q08460 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Kcnma1Q08460 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kcnma1Q08460 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kcnma1Q08460 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kcnma1Q08460 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kcnma1Q08460 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kcnma1Q08460 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Kcnma1Q08460 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kcnma1Q08460 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kcnma1Q08460 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kcnma1Q08460 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kcnma1Q08460 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kcnma1Q08460 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Kcnma1Q08460 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Kcnma1Q08460 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kcnma1Q08460 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kcnma1Q08460 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kcnma1Q08460 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kcnma1Q08460 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kcnma1Q08460 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kcnma1Q08460 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kcnma1Q08460 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kcnma1Q08460 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kcnma1Q08460 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Kcnma1Q08460 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kcnma1Q08460 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kcnma1Q08460 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Kcnma1Q08460 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kcnma1Q08460 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kcnma1Q08460 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kcnma1Q08460 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kcnma1Q08460 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kcnma1Q08460 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kcnma1Q08460 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kcnma1Q08460 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kcnma1Q08460 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kcnma1Q08460 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kcnma1Q08460 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kcnma1Q08460 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kcnma1Q08460 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kcnma1Q08460 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Kcnma1Q08460 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kcnma1Q08460 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kcnma1Q08460 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kcnma1Q08460 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kcnma1Q08460 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kcnma1Q08460 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kcnma1Q08460 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kcnma1Q08460 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kcnma1Q08460 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kcnma1Q08460 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kcnma1Q08460 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kcnma1Q08460 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Kcnma1Q08460 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kcnma1Q08460 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kcnma1Q08460 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kcnma1Q08460 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kcnma1Q08460 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kcnma1Q08460 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kcnma1Q08460 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kcnma1Q08460 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kcnma1Q08460 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kcnma1Q08460 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kcnma1Q08460 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kcnma1Q08460 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kcnma1Q08460 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kcnma1Q08460 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kcnma1Q08460 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kcnma1Q08460 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kcnma1Q08460 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kcnma1Q08460 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kcnma1Q08460 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kcnma1Q08460 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kcnma1Q08460 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kcnma1Q08460 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kcnma1Q08460 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Kcnma1Q08460 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kcnma1Q08460 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms