Protein–RNA interactions for Protein: Q06219

Nr4a2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a2Q06219 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr4a2Q06219 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr4a2Q06219 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr4a2Q06219 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nr4a2Q06219 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nr4a2Q06219 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr4a2Q06219 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr4a2Q06219 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr4a2Q06219 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr4a2Q06219 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr4a2Q06219 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr4a2Q06219 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr4a2Q06219 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr4a2Q06219 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr4a2Q06219 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr4a2Q06219 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr4a2Q06219 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr4a2Q06219 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr4a2Q06219 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr4a2Q06219 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr4a2Q06219 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr4a2Q06219 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr4a2Q06219 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr4a2Q06219 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr4a2Q06219 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr4a2Q06219 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr4a2Q06219 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr4a2Q06219 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr4a2Q06219 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr4a2Q06219 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr4a2Q06219 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr4a2Q06219 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr4a2Q06219 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr4a2Q06219 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr4a2Q06219 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr4a2Q06219 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr4a2Q06219 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr4a2Q06219 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr4a2Q06219 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr4a2Q06219 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr4a2Q06219 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr4a2Q06219 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr4a2Q06219 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr4a2Q06219 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr4a2Q06219 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr4a2Q06219 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr4a2Q06219 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr4a2Q06219 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr4a2Q06219 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr4a2Q06219 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr4a2Q06219 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr4a2Q06219 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr4a2Q06219 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr4a2Q06219 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr4a2Q06219 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr4a2Q06219 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr4a2Q06219 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr4a2Q06219 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr4a2Q06219 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr4a2Q06219 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr4a2Q06219 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr4a2Q06219 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr4a2Q06219 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr4a2Q06219 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr4a2Q06219 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr4a2Q06219 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr4a2Q06219 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr4a2Q06219 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr4a2Q06219 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr4a2Q06219 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr4a2Q06219 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nr4a2Q06219 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nr4a2Q06219 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nr4a2Q06219 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nr4a2Q06219 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nr4a2Q06219 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nr4a2Q06219 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nr4a2Q06219 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nr4a2Q06219 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nr4a2Q06219 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nr4a2Q06219 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nr4a2Q06219 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nr4a2Q06219 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nr4a2Q06219 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nr4a2Q06219 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nr4a2Q06219 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nr4a2Q06219 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nr4a2Q06219 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nr4a2Q06219 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nr4a2Q06219 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nr4a2Q06219 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nr4a2Q06219 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nr4a2Q06219 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nr4a2Q06219 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nr4a2Q06219 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nr4a2Q06219 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nr4a2Q06219 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nr4a2Q06219 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nr4a2Q06219 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nr4a2Q06219 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms