Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna1cQ01815 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna1cQ01815 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna1cQ01815 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna1cQ01815 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna1cQ01815 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna1cQ01815 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna1cQ01815 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna1cQ01815 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna1cQ01815 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna1cQ01815 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna1cQ01815 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna1cQ01815 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna1cQ01815 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna1cQ01815 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna1cQ01815 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna1cQ01815 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna1cQ01815 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna1cQ01815 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna1cQ01815 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna1cQ01815 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna1cQ01815 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna1cQ01815 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna1cQ01815 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna1cQ01815 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna1cQ01815 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna1cQ01815 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna1cQ01815 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna1cQ01815 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna1cQ01815 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna1cQ01815 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna1cQ01815 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna1cQ01815 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cacna1cQ01815 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1cQ01815 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1cQ01815 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1cQ01815 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1cQ01815 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1cQ01815 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1cQ01815 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna1cQ01815 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna1cQ01815 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna1cQ01815 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna1cQ01815 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna1cQ01815 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna1cQ01815 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna1cQ01815 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna1cQ01815 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna1cQ01815 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna1cQ01815 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna1cQ01815 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna1cQ01815 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cacna1cQ01815 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacna1cQ01815 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna1cQ01815 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna1cQ01815 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna1cQ01815 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna1cQ01815 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna1cQ01815 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna1cQ01815 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna1cQ01815 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna1cQ01815 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna1cQ01815 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna1cQ01815 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna1cQ01815 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna1cQ01815 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna1cQ01815 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacna1cQ01815 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacna1cQ01815 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacna1cQ01815 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cacna1cQ01815 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna1cQ01815 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna1cQ01815 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna1cQ01815 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna1cQ01815 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna1cQ01815 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna1cQ01815 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna1cQ01815 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna1cQ01815 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna1cQ01815 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna1cQ01815 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna1cQ01815 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna1cQ01815 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna1cQ01815 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna1cQ01815 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna1cQ01815 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna1cQ01815 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna1cQ01815 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna1cQ01815 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna1cQ01815 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna1cQ01815 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna1cQ01815 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna1cQ01815 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna1cQ01815 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna1cQ01815 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna1cQ01815 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna1cQ01815 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna1cQ01815 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna1cQ01815 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna1cQ01815 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms