Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbx1P82976 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbx1P82976 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbx1P82976 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbx1P82976 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbx1P82976 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbx1P82976 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbx1P82976 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbx1P82976 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbx1P82976 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbx1P82976 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbx1P82976 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbx1P82976 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gbx1P82976 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbx1P82976 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbx1P82976 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbx1P82976 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbx1P82976 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbx1P82976 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbx1P82976 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbx1P82976 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbx1P82976 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbx1P82976 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbx1P82976 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbx1P82976 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbx1P82976 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gbx1P82976 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gbx1P82976 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gbx1P82976 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbx1P82976 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbx1P82976 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbx1P82976 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbx1P82976 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbx1P82976 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbx1P82976 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbx1P82976 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbx1P82976 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbx1P82976 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbx1P82976 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbx1P82976 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbx1P82976 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbx1P82976 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbx1P82976 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbx1P82976 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbx1P82976 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gbx1P82976 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbx1P82976 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbx1P82976 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbx1P82976 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbx1P82976 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbx1P82976 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbx1P82976 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbx1P82976 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbx1P82976 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbx1P82976 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbx1P82976 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbx1P82976 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbx1P82976 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbx1P82976 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbx1P82976 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbx1P82976 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbx1P82976 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbx1P82976 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbx1P82976 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbx1P82976 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbx1P82976 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbx1P82976 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbx1P82976 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbx1P82976 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbx1P82976 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbx1P82976 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbx1P82976 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbx1P82976 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbx1P82976 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbx1P82976 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbx1P82976 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gbx1P82976 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbx1P82976 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbx1P82976 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbx1P82976 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbx1P82976 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbx1P82976 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbx1P82976 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbx1P82976 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbx1P82976 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbx1P82976 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbx1P82976 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbx1P82976 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbx1P82976 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbx1P82976 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbx1P82976 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbx1P82976 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbx1P82976 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbx1P82976 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbx1P82976 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbx1P82976 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbx1P82976 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbx1P82976 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbx1P82976 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbx1P82976 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms