Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gjb6P70689 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gjb6P70689 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gjb6P70689 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gjb6P70689 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gjb6P70689 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Gjb6P70689 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gjb6P70689 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gjb6P70689 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gjb6P70689 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gjb6P70689 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Gjb6P70689 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gjb6P70689 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gjb6P70689 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gjb6P70689 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gjb6P70689 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gjb6P70689 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gjb6P70689 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gjb6P70689 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gjb6P70689 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gjb6P70689 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gjb6P70689 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gjb6P70689 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gjb6P70689 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gjb6P70689 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gjb6P70689 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gjb6P70689 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gjb6P70689 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gjb6P70689 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Gjb6P70689 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gjb6P70689 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Gjb6P70689 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gjb6P70689 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gjb6P70689 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gjb6P70689 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gjb6P70689 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gjb6P70689 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gjb6P70689 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gjb6P70689 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gjb6P70689 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gjb6P70689 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gjb6P70689 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gjb6P70689 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gjb6P70689 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gjb6P70689 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gjb6P70689 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gjb6P70689 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gjb6P70689 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gjb6P70689 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gjb6P70689 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gjb6P70689 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gjb6P70689 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gjb6P70689 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gjb6P70689 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gjb6P70689 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Gjb6P70689 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gjb6P70689 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gjb6P70689 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gjb6P70689 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gjb6P70689 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gjb6P70689 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gjb6P70689 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gjb6P70689 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gjb6P70689 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gjb6P70689 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gjb6P70689 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gjb6P70689 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gjb6P70689 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gjb6P70689 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gjb6P70689 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gjb6P70689 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gjb6P70689 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gjb6P70689 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gjb6P70689 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gjb6P70689 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gjb6P70689 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gjb6P70689 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gjb6P70689 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gjb6P70689 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gjb6P70689 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gjb6P70689 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gjb6P70689 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gjb6P70689 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gjb6P70689 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gjb6P70689 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gjb6P70689 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gjb6P70689 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gjb6P70689 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gjb6P70689 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gjb6P70689 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gjb6P70689 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gjb6P70689 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gjb6P70689 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gjb6P70689 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gjb6P70689 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gjb6P70689 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gjb6P70689 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gjb6P70689 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gjb6P70689 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gjb6P70689 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms