Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sparcl1P70663 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sparcl1P70663 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sparcl1P70663 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sparcl1P70663 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sparcl1P70663 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sparcl1P70663 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sparcl1P70663 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sparcl1P70663 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sparcl1P70663 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sparcl1P70663 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sparcl1P70663 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sparcl1P70663 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sparcl1P70663 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sparcl1P70663 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sparcl1P70663 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sparcl1P70663 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sparcl1P70663 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sparcl1P70663 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Sparcl1P70663 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Sparcl1P70663 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sparcl1P70663 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sparcl1P70663 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sparcl1P70663 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sparcl1P70663 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sparcl1P70663 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sparcl1P70663 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sparcl1P70663 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sparcl1P70663 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sparcl1P70663 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Sparcl1P70663 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Sparcl1P70663 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Sparcl1P70663 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sparcl1P70663 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sparcl1P70663 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sparcl1P70663 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sparcl1P70663 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sparcl1P70663 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sparcl1P70663 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sparcl1P70663 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sparcl1P70663 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sparcl1P70663 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sparcl1P70663 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sparcl1P70663 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sparcl1P70663 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sparcl1P70663 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sparcl1P70663 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sparcl1P70663 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sparcl1P70663 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sparcl1P70663 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Sparcl1P70663 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sparcl1P70663 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sparcl1P70663 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sparcl1P70663 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sparcl1P70663 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Sparcl1P70663 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sparcl1P70663 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sparcl1P70663 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sparcl1P70663 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sparcl1P70663 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sparcl1P70663 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sparcl1P70663 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sparcl1P70663 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sparcl1P70663 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sparcl1P70663 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sparcl1P70663 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sparcl1P70663 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sparcl1P70663 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sparcl1P70663 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sparcl1P70663 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sparcl1P70663 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sparcl1P70663 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sparcl1P70663 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sparcl1P70663 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Sparcl1P70663 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Sparcl1P70663 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sparcl1P70663 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sparcl1P70663 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sparcl1P70663 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sparcl1P70663 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sparcl1P70663 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Sparcl1P70663 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sparcl1P70663 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sparcl1P70663 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sparcl1P70663 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sparcl1P70663 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sparcl1P70663 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Sparcl1P70663 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sparcl1P70663 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sparcl1P70663 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sparcl1P70663 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sparcl1P70663 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sparcl1P70663 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sparcl1P70663 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sparcl1P70663 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sparcl1P70663 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Sparcl1P70663 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sparcl1P70663 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sparcl1P70663 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sparcl1P70663 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms