Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf6P70196 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf6P70196 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Traf6P70196 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Traf6P70196 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Traf6P70196 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Traf6P70196 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Traf6P70196 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Traf6P70196 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Traf6P70196 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Traf6P70196 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Traf6P70196 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Traf6P70196 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Traf6P70196 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Traf6P70196 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Traf6P70196 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Traf6P70196 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Traf6P70196 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Traf6P70196 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Traf6P70196 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Traf6P70196 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Traf6P70196 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Traf6P70196 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Traf6P70196 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Traf6P70196 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Traf6P70196 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Traf6P70196 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Traf6P70196 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Traf6P70196 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf6P70196 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf6P70196 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf6P70196 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Traf6P70196 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Traf6P70196 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Traf6P70196 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Traf6P70196 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Traf6P70196 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Traf6P70196 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Traf6P70196 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Traf6P70196 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Traf6P70196 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Traf6P70196 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Traf6P70196 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Traf6P70196 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf6P70196 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf6P70196 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf6P70196 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf6P70196 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf6P70196 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf6P70196 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf6P70196 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf6P70196 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf6P70196 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf6P70196 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf6P70196 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf6P70196 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf6P70196 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Traf6P70196 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Traf6P70196 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Traf6P70196 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Traf6P70196 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf6P70196 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf6P70196 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf6P70196 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf6P70196 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf6P70196 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf6P70196 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf6P70196 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf6P70196 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf6P70196 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf6P70196 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf6P70196 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf6P70196 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Traf6P70196 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Traf6P70196 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf6P70196 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf6P70196 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf6P70196 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf6P70196 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf6P70196 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf6P70196 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf6P70196 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf6P70196 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf6P70196 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf6P70196 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf6P70196 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf6P70196 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf6P70196 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf6P70196 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf6P70196 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf6P70196 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf6P70196 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf6P70196 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Traf6P70196 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Traf6P70196 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Traf6P70196 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Traf6P70196 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Traf6P70196 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Traf6P70196 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Traf6P70196 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms