Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Crip1P63254 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Crip1P63254 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Crip1P63254 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Crip1P63254 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Crip1P63254 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Crip1P63254 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Crip1P63254 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Crip1P63254 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Crip1P63254 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Crip1P63254 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Crip1P63254 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Crip1P63254 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Crip1P63254 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Crip1P63254 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Crip1P63254 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Crip1P63254 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Crip1P63254 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Crip1P63254 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Crip1P63254 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Crip1P63254 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Crip1P63254 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Crip1P63254 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Crip1P63254 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Crip1P63254 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Crip1P63254 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Crip1P63254 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Crip1P63254 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Crip1P63254 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Crip1P63254 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Crip1P63254 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Crip1P63254 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Crip1P63254 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Crip1P63254 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crip1P63254 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crip1P63254 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Crip1P63254 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Crip1P63254 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Crip1P63254 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Crip1P63254 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Crip1P63254 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crip1P63254 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crip1P63254 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crip1P63254 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crip1P63254 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Crip1P63254 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Crip1P63254 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Crip1P63254 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crip1P63254 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crip1P63254 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crip1P63254 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crip1P63254 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crip1P63254 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crip1P63254 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crip1P63254 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Crip1P63254 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Crip1P63254 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crip1P63254 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crip1P63254 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Crip1P63254 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Crip1P63254 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Crip1P63254 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Crip1P63254 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crip1P63254 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crip1P63254 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Crip1P63254 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crip1P63254 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crip1P63254 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Crip1P63254 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Crip1P63254 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Crip1P63254 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Crip1P63254 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Crip1P63254 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Crip1P63254 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Crip1P63254 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Crip1P63254 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Crip1P63254 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Crip1P63254 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Crip1P63254 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Crip1P63254 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Crip1P63254 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Crip1P63254 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Crip1P63254 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Crip1P63254 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Crip1P63254 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Crip1P63254 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Crip1P63254 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Crip1P63254 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Crip1P63254 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Crip1P63254 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Crip1P63254 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Crip1P63254 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Crip1P63254 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Crip1P63254 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Crip1P63254 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Crip1P63254 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Crip1P63254 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Crip1P63254 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Crip1P63254 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Crip1P63254 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms