Protein–RNA interactions for Protein: P59326

Ythdf1, YTH domain-containing family protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf1P59326 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdf1P59326 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdf1P59326 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdf1P59326 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdf1P59326 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdf1P59326 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ythdf1P59326 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdf1P59326 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdf1P59326 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ythdf1P59326 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ythdf1P59326 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ythdf1P59326 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ythdf1P59326 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ythdf1P59326 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ythdf1P59326 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ythdf1P59326 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ythdf1P59326 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ythdf1P59326 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ythdf1P59326 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ythdf1P59326 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ythdf1P59326 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ythdf1P59326 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ythdf1P59326 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ythdf1P59326 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ythdf1P59326 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ythdf1P59326 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ythdf1P59326 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ythdf1P59326 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ythdf1P59326 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ythdf1P59326 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ythdf1P59326 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ythdf1P59326 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ythdf1P59326 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ythdf1P59326 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ythdf1P59326 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ythdf1P59326 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ythdf1P59326 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ythdf1P59326 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ythdf1P59326 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ythdf1P59326 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ythdf1P59326 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ythdf1P59326 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ythdf1P59326 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ythdf1P59326 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ythdf1P59326 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdf1P59326 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdf1P59326 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdf1P59326 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdf1P59326 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdf1P59326 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdf1P59326 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdf1P59326 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdf1P59326 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdf1P59326 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdf1P59326 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdf1P59326 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ythdf1P59326 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ythdf1P59326 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ythdf1P59326 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdf1P59326 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdf1P59326 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdf1P59326 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdf1P59326 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ythdf1P59326 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ythdf1P59326 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ythdf1P59326 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ythdf1P59326 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ythdf1P59326 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ythdf1P59326 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ythdf1P59326 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ythdf1P59326 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ythdf1P59326 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ythdf1P59326 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ythdf1P59326 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ythdf1P59326 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ythdf1P59326 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ythdf1P59326 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ythdf1P59326 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ythdf1P59326 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ythdf1P59326 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ythdf1P59326 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ythdf1P59326 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdf1P59326 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdf1P59326 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdf1P59326 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdf1P59326 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdf1P59326 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdf1P59326 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdf1P59326 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdf1P59326 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdf1P59326 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdf1P59326 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdf1P59326 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdf1P59326 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdf1P59326 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdf1P59326 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ythdf1P59326 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ythdf1P59326 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ythdf1P59326 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ythdf1P59326 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms