Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup43P59235 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup43P59235 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup43P59235 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup43P59235 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup43P59235 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup43P59235 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup43P59235 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup43P59235 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup43P59235 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup43P59235 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup43P59235 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup43P59235 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup43P59235 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup43P59235 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup43P59235 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup43P59235 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup43P59235 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup43P59235 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup43P59235 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup43P59235 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup43P59235 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup43P59235 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup43P59235 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup43P59235 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup43P59235 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nup43P59235 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup43P59235 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup43P59235 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup43P59235 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup43P59235 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup43P59235 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup43P59235 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup43P59235 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup43P59235 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup43P59235 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup43P59235 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup43P59235 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup43P59235 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup43P59235 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup43P59235 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup43P59235 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup43P59235 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup43P59235 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup43P59235 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup43P59235 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup43P59235 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup43P59235 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup43P59235 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup43P59235 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup43P59235 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup43P59235 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup43P59235 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup43P59235 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup43P59235 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup43P59235 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup43P59235 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup43P59235 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup43P59235 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup43P59235 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup43P59235 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup43P59235 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup43P59235 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup43P59235 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nup43P59235 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup43P59235 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup43P59235 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup43P59235 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup43P59235 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup43P59235 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup43P59235 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup43P59235 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup43P59235 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup43P59235 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup43P59235 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup43P59235 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup43P59235 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup43P59235 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup43P59235 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup43P59235 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup43P59235 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup43P59235 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup43P59235 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nup43P59235 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nup43P59235 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup43P59235 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup43P59235 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup43P59235 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup43P59235 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup43P59235 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup43P59235 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup43P59235 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup43P59235 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup43P59235 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup43P59235 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup43P59235 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup43P59235 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup43P59235 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup43P59235 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup43P59235 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms