Protein–RNA interactions for Protein: P56567

Csta, Cystatin-A, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CstaP56567 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CstaP56567 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CstaP56567 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CstaP56567 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CstaP56567 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CstaP56567 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CstaP56567 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CstaP56567 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CstaP56567 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CstaP56567 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CstaP56567 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CstaP56567 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CstaP56567 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CstaP56567 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CstaP56567 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CstaP56567 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CstaP56567 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CstaP56567 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CstaP56567 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CstaP56567 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CstaP56567 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CstaP56567 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CstaP56567 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CstaP56567 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CstaP56567 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CstaP56567 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CstaP56567 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CstaP56567 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CstaP56567 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CstaP56567 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CstaP56567 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CstaP56567 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CstaP56567 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CstaP56567 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CstaP56567 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CstaP56567 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CstaP56567 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CstaP56567 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CstaP56567 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CstaP56567 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CstaP56567 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CstaP56567 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CstaP56567 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CstaP56567 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CstaP56567 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CstaP56567 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CstaP56567 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CstaP56567 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CstaP56567 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CstaP56567 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CstaP56567 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CstaP56567 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CstaP56567 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CstaP56567 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CstaP56567 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CstaP56567 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CstaP56567 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CstaP56567 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CstaP56567 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CstaP56567 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CstaP56567 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CstaP56567 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CstaP56567 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CstaP56567 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CstaP56567 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CstaP56567 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CstaP56567 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CstaP56567 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CstaP56567 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CstaP56567 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CstaP56567 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CstaP56567 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CstaP56567 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CstaP56567 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CstaP56567 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CstaP56567 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CstaP56567 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CstaP56567 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CstaP56567 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CstaP56567 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CstaP56567 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CstaP56567 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CstaP56567 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CstaP56567 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CstaP56567 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CstaP56567 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CstaP56567 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CstaP56567 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CstaP56567 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CstaP56567 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CstaP56567 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CstaP56567 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CstaP56567 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CstaP56567 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CstaP56567 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CstaP56567 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CstaP56567 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CstaP56567 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CstaP56567 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CstaP56567 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms