Protein–RNA interactions for Protein: P54279

Pms2, Mismatch repair endonuclease PMS2, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms2P54279 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pms2P54279 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pms2P54279 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pms2P54279 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pms2P54279 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pms2P54279 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pms2P54279 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pms2P54279 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pms2P54279 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pms2P54279 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pms2P54279 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pms2P54279 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pms2P54279 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pms2P54279 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pms2P54279 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pms2P54279 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pms2P54279 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pms2P54279 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pms2P54279 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pms2P54279 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pms2P54279 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pms2P54279 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pms2P54279 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pms2P54279 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pms2P54279 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Pms2P54279 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Pms2P54279 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pms2P54279 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pms2P54279 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pms2P54279 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pms2P54279 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pms2P54279 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pms2P54279 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pms2P54279 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pms2P54279 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pms2P54279 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pms2P54279 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pms2P54279 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pms2P54279 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pms2P54279 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pms2P54279 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pms2P54279 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pms2P54279 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pms2P54279 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pms2P54279 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pms2P54279 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pms2P54279 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pms2P54279 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pms2P54279 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pms2P54279 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pms2P54279 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pms2P54279 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pms2P54279 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pms2P54279 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pms2P54279 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pms2P54279 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pms2P54279 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pms2P54279 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pms2P54279 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pms2P54279 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pms2P54279 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pms2P54279 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pms2P54279 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pms2P54279 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pms2P54279 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pms2P54279 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pms2P54279 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pms2P54279 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pms2P54279 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pms2P54279 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pms2P54279 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pms2P54279 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pms2P54279 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pms2P54279 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pms2P54279 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pms2P54279 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pms2P54279 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pms2P54279 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pms2P54279 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pms2P54279 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pms2P54279 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pms2P54279 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pms2P54279 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pms2P54279 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pms2P54279 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pms2P54279 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pms2P54279 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pms2P54279 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pms2P54279 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pms2P54279 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pms2P54279 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pms2P54279 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pms2P54279 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pms2P54279 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pms2P54279 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pms2P54279 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pms2P54279 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pms2P54279 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pms2P54279 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pms2P54279 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1122.4 ms