Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC30,44■■■□□ 2,46
Fgd1P52734 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Fgd1P52734 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Fgd1P52734 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Fgd1P52734 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Fgd1P52734 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,41■■■□□ 2,46
Fgd1P52734 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,41■■■□□ 2,46
Fgd1P52734 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC30,4■■■□□ 2,46
Fgd1P52734 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Fgd1P52734 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Fgd1P52734 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Fgd1P52734 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Fgd1P52734 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Fgd1P52734 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Fgd1P52734 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Fgd1P52734 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,38■■■□□ 2,45
Fgd1P52734 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,38■■■□□ 2,45
Fgd1P52734 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Fgd1P52734 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Fgd1P52734 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Fgd1P52734 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Fgd1P52734 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Fgd1P52734 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Fgd1P52734 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC30,35■■■□□ 2,45
Fgd1P52734 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Fgd1P52734 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Fgd1P52734 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Fgd1P52734 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,34■■■□□ 2,45
Fgd1P52734 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Fgd1P52734 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Fgd1P52734 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC30,31■■■□□ 2,44
Fgd1P52734 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC30,3■■■□□ 2,44
Fgd1P52734 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Fgd1P52734 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Fgd1P52734 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Fgd1P52734 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Fgd1P52734 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC30,27■■■□□ 2,44
Fgd1P52734 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC30,27■■■□□ 2,44
Fgd1P52734 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,44
Fgd1P52734 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30,25■■■□□ 2,43
Fgd1P52734 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC30,24■■■□□ 2,43
Fgd1P52734 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC30,24■■■□□ 2,43
Fgd1P52734 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,24■■■□□ 2,43
Fgd1P52734 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Fgd1P52734 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Fgd1P52734 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Fgd1P52734 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC30,21■■■□□ 2,43
Fgd1P52734 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Fgd1P52734 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Fgd1P52734 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Fgd1P52734 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Fgd1P52734 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Fgd1P52734 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Fgd1P52734 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Fgd1P52734 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Fgd1P52734 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Fgd1P52734 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Fgd1P52734 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Fgd1P52734 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Fgd1P52734 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Fgd1P52734 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Fgd1P52734 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Fgd1P52734 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Fgd1P52734 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,11■■■□□ 2,41
Fgd1P52734 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC30,11■■■□□ 2,41
Fgd1P52734 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Fgd1P52734 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Fgd1P52734 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Fgd1P52734 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Fgd1P52734 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC30,06■■■□□ 2,4
Fgd1P52734 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Fgd1P52734 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Fgd1P52734 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Fgd1P52734 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Fgd1P52734 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC30,04■■■□□ 2,4
Fgd1P52734 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Fgd1P52734 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Fgd1P52734 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC30,04■■■□□ 2,4
Fgd1P52734 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC30,03■■■□□ 2,4
Fgd1P52734 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Fgd1P52734 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Fgd1P52734 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC30,02■■■□□ 2,4
Fgd1P52734 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,02■■■□□ 2,4
Fgd1P52734 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,4
Fgd1P52734 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC30,01■■■□□ 2,39
Fgd1P52734 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Fgd1P52734 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Fgd1P52734 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2,39
Fgd1P52734 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2,39
Fgd1P52734 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29,99■■■□□ 2,39
Fgd1P52734 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Fgd1P52734 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29,98■■■□□ 2,39
Fgd1P52734 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,98■■■□□ 2,39
Fgd1P52734 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29,97■■■□□ 2,39
Fgd1P52734 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Fgd1P52734 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29,96■■■□□ 2,39
Fgd1P52734 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Fgd1P52734 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,95■■■□□ 2,39
Fgd1P52734 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Fgd1P52734 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26,5 ms