Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fen1P39749 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fen1P39749 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fen1P39749 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fen1P39749 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fen1P39749 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fen1P39749 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fen1P39749 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fen1P39749 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fen1P39749 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fen1P39749 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fen1P39749 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fen1P39749 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fen1P39749 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Fen1P39749 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Fen1P39749 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fen1P39749 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fen1P39749 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fen1P39749 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fen1P39749 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fen1P39749 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fen1P39749 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fen1P39749 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fen1P39749 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fen1P39749 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fen1P39749 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fen1P39749 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fen1P39749 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fen1P39749 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fen1P39749 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fen1P39749 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fen1P39749 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fen1P39749 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fen1P39749 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fen1P39749 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fen1P39749 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fen1P39749 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fen1P39749 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Fen1P39749 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fen1P39749 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fen1P39749 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fen1P39749 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fen1P39749 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fen1P39749 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fen1P39749 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fen1P39749 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fen1P39749 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fen1P39749 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fen1P39749 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fen1P39749 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fen1P39749 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fen1P39749 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fen1P39749 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fen1P39749 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fen1P39749 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fen1P39749 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fen1P39749 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fen1P39749 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fen1P39749 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fen1P39749 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fen1P39749 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fen1P39749 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fen1P39749 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fen1P39749 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fen1P39749 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fen1P39749 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fen1P39749 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fen1P39749 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fen1P39749 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fen1P39749 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fen1P39749 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fen1P39749 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fen1P39749 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Fen1P39749 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fen1P39749 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fen1P39749 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fen1P39749 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fen1P39749 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fen1P39749 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fen1P39749 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fen1P39749 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fen1P39749 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fen1P39749 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fen1P39749 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Fen1P39749 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fen1P39749 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fen1P39749 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fen1P39749 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fen1P39749 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fen1P39749 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fen1P39749 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fen1P39749 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fen1P39749 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fen1P39749 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fen1P39749 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fen1P39749 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fen1P39749 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fen1P39749 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fen1P39749 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fen1P39749 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms