Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PpardP35396 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PpardP35396 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PpardP35396 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PpardP35396 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PpardP35396 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PpardP35396 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PpardP35396 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PpardP35396 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PpardP35396 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PpardP35396 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PpardP35396 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PpardP35396 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PpardP35396 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PpardP35396 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PpardP35396 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PpardP35396 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PpardP35396 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PpardP35396 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PpardP35396 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PpardP35396 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PpardP35396 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PpardP35396 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PpardP35396 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PpardP35396 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PpardP35396 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PpardP35396 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PpardP35396 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PpardP35396 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PpardP35396 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PpardP35396 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PpardP35396 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PpardP35396 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PpardP35396 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PpardP35396 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PpardP35396 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PpardP35396 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PpardP35396 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PpardP35396 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PpardP35396 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PpardP35396 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PpardP35396 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PpardP35396 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PpardP35396 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PpardP35396 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PpardP35396 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PpardP35396 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PpardP35396 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PpardP35396 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PpardP35396 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PpardP35396 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PpardP35396 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PpardP35396 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PpardP35396 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PpardP35396 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PpardP35396 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PpardP35396 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PpardP35396 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PpardP35396 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PpardP35396 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PpardP35396 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PpardP35396 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PpardP35396 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PpardP35396 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PpardP35396 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PpardP35396 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PpardP35396 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PpardP35396 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PpardP35396 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PpardP35396 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PpardP35396 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PpardP35396 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PpardP35396 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PpardP35396 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PpardP35396 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PpardP35396 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PpardP35396 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PpardP35396 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PpardP35396 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PpardP35396 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PpardP35396 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PpardP35396 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PpardP35396 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PpardP35396 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PpardP35396 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PpardP35396 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PpardP35396 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PpardP35396 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PpardP35396 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PpardP35396 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PpardP35396 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PpardP35396 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PpardP35396 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PpardP35396 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PpardP35396 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PpardP35396 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PpardP35396 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PpardP35396 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PpardP35396 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PpardP35396 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms