Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxd9P28357 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxd9P28357 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxd9P28357 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxd9P28357 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxd9P28357 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxd9P28357 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxd9P28357 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxd9P28357 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxd9P28357 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxd9P28357 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd9P28357 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd9P28357 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd9P28357 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd9P28357 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd9P28357 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd9P28357 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd9P28357 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxd9P28357 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxd9P28357 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxd9P28357 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxd9P28357 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxd9P28357 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd9P28357 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd9P28357 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd9P28357 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxd9P28357 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxd9P28357 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxd9P28357 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Hoxd9P28357 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxd9P28357 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxd9P28357 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxd9P28357 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxd9P28357 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxd9P28357 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxd9P28357 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxd9P28357 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxd9P28357 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxd9P28357 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxd9P28357 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxd9P28357 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxd9P28357 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxd9P28357 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxd9P28357 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxd9P28357 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9P28357 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9P28357 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9P28357 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9P28357 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9P28357 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9P28357 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxd9P28357 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxd9P28357 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxd9P28357 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxd9P28357 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxd9P28357 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxd9P28357 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxd9P28357 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxd9P28357 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxd9P28357 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxd9P28357 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxd9P28357 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxd9P28357 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxd9P28357 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxd9P28357 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd9P28357 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd9P28357 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd9P28357 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd9P28357 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd9P28357 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd9P28357 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxd9P28357 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxd9P28357 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxd9P28357 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxd9P28357 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxd9P28357 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxd9P28357 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxd9P28357 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxd9P28357 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxd9P28357 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxd9P28357 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxd9P28357 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxd9P28357 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxd9P28357 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxd9P28357 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxd9P28357 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxd9P28357 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxd9P28357 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxd9P28357 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxd9P28357 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd9P28357 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxd9P28357 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd9P28357 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd9P28357 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd9P28357 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd9P28357 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd9P28357 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd9P28357 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd9P28357 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd9P28357 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms