Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Etv4P28322 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Etv4P28322 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Etv4P28322 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Etv4P28322 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Etv4P28322 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Etv4P28322 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Etv4P28322 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Etv4P28322 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Etv4P28322 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Etv4P28322 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Etv4P28322 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Etv4P28322 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Etv4P28322 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Etv4P28322 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Etv4P28322 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Etv4P28322 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Etv4P28322 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Etv4P28322 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Etv4P28322 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Etv4P28322 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Etv4P28322 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Etv4P28322 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Etv4P28322 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Etv4P28322 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Etv4P28322 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Etv4P28322 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Etv4P28322 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Etv4P28322 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Etv4P28322 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Etv4P28322 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Etv4P28322 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Etv4P28322 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Etv4P28322 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Etv4P28322 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Etv4P28322 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Etv4P28322 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Etv4P28322 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Etv4P28322 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Etv4P28322 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Etv4P28322 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Etv4P28322 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Etv4P28322 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Etv4P28322 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Etv4P28322 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Etv4P28322 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Etv4P28322 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Etv4P28322 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Etv4P28322 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Etv4P28322 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Etv4P28322 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Etv4P28322 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Etv4P28322 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Etv4P28322 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Etv4P28322 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Etv4P28322 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Etv4P28322 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Etv4P28322 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Etv4P28322 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Etv4P28322 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Etv4P28322 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Etv4P28322 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Etv4P28322 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Etv4P28322 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Etv4P28322 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Etv4P28322 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Etv4P28322 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Etv4P28322 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Etv4P28322 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Etv4P28322 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Etv4P28322 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Etv4P28322 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Etv4P28322 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Etv4P28322 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Etv4P28322 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Etv4P28322 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Etv4P28322 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Etv4P28322 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Etv4P28322 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Etv4P28322 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Etv4P28322 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Etv4P28322 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Etv4P28322 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Etv4P28322 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Etv4P28322 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Etv4P28322 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Etv4P28322 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Etv4P28322 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Etv4P28322 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Etv4P28322 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Etv4P28322 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Etv4P28322 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Etv4P28322 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Etv4P28322 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Etv4P28322 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Etv4P28322 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Etv4P28322 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Etv4P28322 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Etv4P28322 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Etv4P28322 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms