Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ChgaP26339 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ChgaP26339 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ChgaP26339 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ChgaP26339 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ChgaP26339 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ChgaP26339 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ChgaP26339 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ChgaP26339 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ChgaP26339 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ChgaP26339 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ChgaP26339 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ChgaP26339 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ChgaP26339 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ChgaP26339 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ChgaP26339 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ChgaP26339 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ChgaP26339 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ChgaP26339 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ChgaP26339 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ChgaP26339 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ChgaP26339 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ChgaP26339 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ChgaP26339 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ChgaP26339 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ChgaP26339 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ChgaP26339 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ChgaP26339 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ChgaP26339 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ChgaP26339 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ChgaP26339 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ChgaP26339 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ChgaP26339 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ChgaP26339 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ChgaP26339 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ChgaP26339 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ChgaP26339 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ChgaP26339 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ChgaP26339 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.24
ChgaP26339 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ChgaP26339 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ChgaP26339 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ChgaP26339 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ChgaP26339 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ChgaP26339 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ChgaP26339 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ChgaP26339 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ChgaP26339 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ChgaP26339 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ChgaP26339 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ChgaP26339 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ChgaP26339 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ChgaP26339 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ChgaP26339 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ChgaP26339 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ChgaP26339 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ChgaP26339 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ChgaP26339 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ChgaP26339 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ChgaP26339 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ChgaP26339 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ChgaP26339 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ChgaP26339 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ChgaP26339 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ChgaP26339 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ChgaP26339 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ChgaP26339 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ChgaP26339 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ChgaP26339 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ChgaP26339 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ChgaP26339 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ChgaP26339 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ChgaP26339 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ChgaP26339 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ChgaP26339 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ChgaP26339 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ChgaP26339 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ChgaP26339 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ChgaP26339 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ChgaP26339 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ChgaP26339 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ChgaP26339 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ChgaP26339 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ChgaP26339 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ChgaP26339 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ChgaP26339 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ChgaP26339 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ChgaP26339 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ChgaP26339 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ChgaP26339 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ChgaP26339 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ChgaP26339 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ChgaP26339 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ChgaP26339 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ChgaP26339 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ChgaP26339 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ChgaP26339 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ChgaP26339 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ChgaP26339 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ChgaP26339 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms