Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd44P15379 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd44P15379 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd44P15379 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd44P15379 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd44P15379 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cd44P15379 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cd44P15379 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cd44P15379 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cd44P15379 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cd44P15379 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cd44P15379 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cd44P15379 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cd44P15379 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cd44P15379 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cd44P15379 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cd44P15379 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cd44P15379 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cd44P15379 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cd44P15379 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cd44P15379 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cd44P15379 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cd44P15379 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cd44P15379 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cd44P15379 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cd44P15379 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cd44P15379 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cd44P15379 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cd44P15379 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cd44P15379 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cd44P15379 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cd44P15379 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cd44P15379 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cd44P15379 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cd44P15379 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cd44P15379 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cd44P15379 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cd44P15379 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cd44P15379 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cd44P15379 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cd44P15379 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cd44P15379 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cd44P15379 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cd44P15379 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cd44P15379 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cd44P15379 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cd44P15379 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cd44P15379 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cd44P15379 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cd44P15379 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cd44P15379 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cd44P15379 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cd44P15379 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cd44P15379 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cd44P15379 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cd44P15379 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cd44P15379 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cd44P15379 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cd44P15379 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cd44P15379 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cd44P15379 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cd44P15379 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cd44P15379 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cd44P15379 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cd44P15379 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cd44P15379 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cd44P15379 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cd44P15379 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cd44P15379 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cd44P15379 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cd44P15379 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cd44P15379 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cd44P15379 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cd44P15379 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cd44P15379 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cd44P15379 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cd44P15379 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cd44P15379 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cd44P15379 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cd44P15379 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cd44P15379 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cd44P15379 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cd44P15379 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cd44P15379 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cd44P15379 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cd44P15379 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cd44P15379 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cd44P15379 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cd44P15379 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd44P15379 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd44P15379 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd44P15379 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd44P15379 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd44P15379 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cd44P15379 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cd44P15379 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cd44P15379 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cd44P15379 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cd44P15379 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cd44P15379 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 306.3 ms