Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nid1P10493 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nid1P10493 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nid1P10493 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nid1P10493 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nid1P10493 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nid1P10493 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nid1P10493 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nid1P10493 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nid1P10493 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nid1P10493 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nid1P10493 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nid1P10493 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nid1P10493 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nid1P10493 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nid1P10493 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nid1P10493 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nid1P10493 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nid1P10493 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nid1P10493 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nid1P10493 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nid1P10493 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nid1P10493 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nid1P10493 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nid1P10493 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nid1P10493 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nid1P10493 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nid1P10493 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nid1P10493 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nid1P10493 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nid1P10493 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nid1P10493 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nid1P10493 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nid1P10493 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nid1P10493 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nid1P10493 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nid1P10493 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nid1P10493 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nid1P10493 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nid1P10493 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nid1P10493 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nid1P10493 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nid1P10493 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nid1P10493 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nid1P10493 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nid1P10493 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nid1P10493 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nid1P10493 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nid1P10493 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nid1P10493 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nid1P10493 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nid1P10493 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nid1P10493 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nid1P10493 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nid1P10493 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nid1P10493 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nid1P10493 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nid1P10493 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nid1P10493 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nid1P10493 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nid1P10493 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nid1P10493 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nid1P10493 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nid1P10493 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nid1P10493 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nid1P10493 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nid1P10493 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nid1P10493 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nid1P10493 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nid1P10493 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nid1P10493 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nid1P10493 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nid1P10493 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nid1P10493 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nid1P10493 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nid1P10493 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nid1P10493 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nid1P10493 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nid1P10493 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nid1P10493 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nid1P10493 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nid1P10493 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nid1P10493 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nid1P10493 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nid1P10493 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nid1P10493 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nid1P10493 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nid1P10493 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nid1P10493 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nid1P10493 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nid1P10493 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nid1P10493 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nid1P10493 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nid1P10493 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nid1P10493 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nid1P10493 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nid1P10493 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nid1P10493 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nid1P10493 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nid1P10493 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.8 ms