Protein–RNA interactions for Protein: P09793

Ctla4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla4P09793 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctla4P09793 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctla4P09793 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctla4P09793 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctla4P09793 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctla4P09793 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctla4P09793 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctla4P09793 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctla4P09793 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctla4P09793 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctla4P09793 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctla4P09793 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctla4P09793 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctla4P09793 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctla4P09793 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctla4P09793 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctla4P09793 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctla4P09793 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctla4P09793 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctla4P09793 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctla4P09793 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctla4P09793 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctla4P09793 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctla4P09793 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctla4P09793 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctla4P09793 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctla4P09793 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctla4P09793 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctla4P09793 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctla4P09793 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctla4P09793 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctla4P09793 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctla4P09793 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctla4P09793 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctla4P09793 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctla4P09793 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctla4P09793 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctla4P09793 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctla4P09793 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctla4P09793 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctla4P09793 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctla4P09793 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctla4P09793 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctla4P09793 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctla4P09793 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctla4P09793 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctla4P09793 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctla4P09793 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctla4P09793 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctla4P09793 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctla4P09793 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctla4P09793 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ctla4P09793 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctla4P09793 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctla4P09793 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctla4P09793 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctla4P09793 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctla4P09793 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctla4P09793 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctla4P09793 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctla4P09793 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctla4P09793 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctla4P09793 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctla4P09793 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctla4P09793 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctla4P09793 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctla4P09793 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctla4P09793 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctla4P09793 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctla4P09793 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctla4P09793 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctla4P09793 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctla4P09793 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctla4P09793 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctla4P09793 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctla4P09793 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctla4P09793 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctla4P09793 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctla4P09793 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctla4P09793 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctla4P09793 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctla4P09793 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctla4P09793 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctla4P09793 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctla4P09793 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctla4P09793 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctla4P09793 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctla4P09793 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctla4P09793 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctla4P09793 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctla4P09793 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctla4P09793 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctla4P09793 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctla4P09793 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctla4P09793 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctla4P09793 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctla4P09793 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctla4P09793 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctla4P09793 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctla4P09793 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms