Protein–RNA interactions for Protein: P03987

Ig gamma-3 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P03987 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P03987 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P03987 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P03987 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P03987 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
P03987 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P03987 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P03987 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P03987 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P03987 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P03987 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P03987 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P03987 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P03987 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P03987 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P03987 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
P03987 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P03987 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P03987 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P03987 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P03987 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
P03987 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P03987 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P03987 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P03987 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P03987 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P03987 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P03987 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P03987 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P03987 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P03987 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P03987 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P03987 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P03987 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P03987 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P03987 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P03987 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P03987 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P03987 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P03987 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P03987 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P03987 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P03987 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P03987 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22■■□□□ 1.11
P03987 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P03987 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P03987 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P03987 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P03987 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P03987 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P03987 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
P03987 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
P03987 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P03987 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
P03987 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P03987 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P03987 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P03987 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P03987 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P03987 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
P03987 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P03987 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P03987 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P03987 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P03987 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P03987 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
P03987 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P03987 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P03987 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
P03987 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P03987 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P03987 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P03987 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P03987 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P03987 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P03987 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P03987 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
P03987 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
P03987 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P03987 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
P03987 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
P03987 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P03987 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P03987 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
P03987 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
P03987 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P03987 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
P03987 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
P03987 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
P03987 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P03987 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
P03987 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
P03987 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P03987 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P03987 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
P03987 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
P03987 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P03987 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
P03987 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P03987 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms