Protein–RNA interactions for Protein: P01843

Ig lambda-1 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01843 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01843 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01843 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01843 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01843 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01843 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01843 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01843 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01843 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01843 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01843 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01843 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01843 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01843 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01843 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01843 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01843 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01843 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01843 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01843 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01843 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01843 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01843 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01843 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01843 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01843 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01843 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01843 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01843 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01843 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01843 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01843 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01843 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01843 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01843 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01843 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01843 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01843 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01843 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01843 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01843 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01843 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01843 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01843 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01843 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01843 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01843 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01843 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01843 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01843 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01843 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01843 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01843 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01843 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01843 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01843 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01843 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01843 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01843 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01843 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01843 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01843 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01843 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01843 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01843 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01843 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01843 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01843 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01843 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01843 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01843 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01843 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01843 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01843 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01843 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01843 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01843 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01843 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01843 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01843 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01843 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01843 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01843 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01843 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01843 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01843 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01843 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01843 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01843 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01843 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01843 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01843 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01843 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01843 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01843 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01843 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01843 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01843 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01843 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01843 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms