Protein–RNA interactions for Protein: P01787

Ig heavy chain V regions TEPC 15/S107/HPCM1/HPCM2/HPCM3, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01787 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
P01787 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01787 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01787 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01787 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01787 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01787 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01787 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01787 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01787 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01787 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01787 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01787 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01787 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01787 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01787 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01787 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01787 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01787 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01787 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01787 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01787 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01787 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01787 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01787 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01787 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
P01787 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
P01787 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01787 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01787 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01787 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01787 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01787 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01787 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01787 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01787 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01787 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01787 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01787 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01787 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01787 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
P01787 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01787 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01787 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01787 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
P01787 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01787 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01787 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01787 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01787 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01787 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01787 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01787 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01787 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01787 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01787 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01787 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01787 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01787 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01787 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01787 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01787 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01787 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01787 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01787 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01787 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01787 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01787 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01787 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01787 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01787 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01787 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01787 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01787 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01787 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01787 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01787 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01787 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01787 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01787 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01787 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01787 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01787 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01787 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01787 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01787 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01787 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01787 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01787 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01787 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01787 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01787 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01787 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01787 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01787 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01787 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01787 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01787 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01787 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01787 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms