Protein–RNA interactions for Protein: O88990

Actn3, Alpha-actinin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn3O88990 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Actn3O88990 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Actn3O88990 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Actn3O88990 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Actn3O88990 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Actn3O88990 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Actn3O88990 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Actn3O88990 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Actn3O88990 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Actn3O88990 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Actn3O88990 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Actn3O88990 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Actn3O88990 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Actn3O88990 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Actn3O88990 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Actn3O88990 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Actn3O88990 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Actn3O88990 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Actn3O88990 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Actn3O88990 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Actn3O88990 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Actn3O88990 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Actn3O88990 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Actn3O88990 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Actn3O88990 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Actn3O88990 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Actn3O88990 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Actn3O88990 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Actn3O88990 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Actn3O88990 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Actn3O88990 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Actn3O88990 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Actn3O88990 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Actn3O88990 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Actn3O88990 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Actn3O88990 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Actn3O88990 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Actn3O88990 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Actn3O88990 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Actn3O88990 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Actn3O88990 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Actn3O88990 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Actn3O88990 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Actn3O88990 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Actn3O88990 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Actn3O88990 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Actn3O88990 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Actn3O88990 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Actn3O88990 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Actn3O88990 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Actn3O88990 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Actn3O88990 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Actn3O88990 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Actn3O88990 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Actn3O88990 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Actn3O88990 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Actn3O88990 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Actn3O88990 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Actn3O88990 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Actn3O88990 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Actn3O88990 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Actn3O88990 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Actn3O88990 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Actn3O88990 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Actn3O88990 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Actn3O88990 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Actn3O88990 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Actn3O88990 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Actn3O88990 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Actn3O88990 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Actn3O88990 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Actn3O88990 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Actn3O88990 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Actn3O88990 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Actn3O88990 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Actn3O88990 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Actn3O88990 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Actn3O88990 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Actn3O88990 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Actn3O88990 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Actn3O88990 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Actn3O88990 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Actn3O88990 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Actn3O88990 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Actn3O88990 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Actn3O88990 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Actn3O88990 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Actn3O88990 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Actn3O88990 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Actn3O88990 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Actn3O88990 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Actn3O88990 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Actn3O88990 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Actn3O88990 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Actn3O88990 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Actn3O88990 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Actn3O88990 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Actn3O88990 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Actn3O88990 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Actn3O88990 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms