Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctnnal1O88327 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctnnal1O88327 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctnnal1O88327 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctnnal1O88327 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctnnal1O88327 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ctnnal1O88327 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ctnnal1O88327 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ctnnal1O88327 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ctnnal1O88327 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ctnnal1O88327 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctnnal1O88327 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctnnal1O88327 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctnnal1O88327 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ctnnal1O88327 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ctnnal1O88327 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ctnnal1O88327 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ctnnal1O88327 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ctnnal1O88327 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ctnnal1O88327 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ctnnal1O88327 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ctnnal1O88327 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ctnnal1O88327 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ctnnal1O88327 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ctnnal1O88327 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ctnnal1O88327 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctnnal1O88327 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctnnal1O88327 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctnnal1O88327 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctnnal1O88327 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctnnal1O88327 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctnnal1O88327 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctnnal1O88327 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ctnnal1O88327 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ctnnal1O88327 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ctnnal1O88327 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ctnnal1O88327 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctnnal1O88327 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctnnal1O88327 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ctnnal1O88327 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ctnnal1O88327 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ctnnal1O88327 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctnnal1O88327 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctnnal1O88327 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctnnal1O88327 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ctnnal1O88327 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ctnnal1O88327 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ctnnal1O88327 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ctnnal1O88327 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ctnnal1O88327 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ctnnal1O88327 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ctnnal1O88327 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctnnal1O88327 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctnnal1O88327 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctnnal1O88327 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctnnal1O88327 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctnnal1O88327 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctnnal1O88327 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctnnal1O88327 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctnnal1O88327 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctnnal1O88327 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctnnal1O88327 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctnnal1O88327 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctnnal1O88327 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctnnal1O88327 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctnnal1O88327 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctnnal1O88327 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctnnal1O88327 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctnnal1O88327 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctnnal1O88327 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctnnal1O88327 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctnnal1O88327 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctnnal1O88327 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctnnal1O88327 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctnnal1O88327 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctnnal1O88327 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctnnal1O88327 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ctnnal1O88327 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctnnal1O88327 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctnnal1O88327 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctnnal1O88327 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctnnal1O88327 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ctnnal1O88327 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctnnal1O88327 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctnnal1O88327 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctnnal1O88327 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctnnal1O88327 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ctnnal1O88327 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ctnnal1O88327 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ctnnal1O88327 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctnnal1O88327 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctnnal1O88327 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctnnal1O88327 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctnnal1O88327 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctnnal1O88327 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctnnal1O88327 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctnnal1O88327 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctnnal1O88327 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctnnal1O88327 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctnnal1O88327 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 419.4 ms