Protein–RNA interactions for Protein: O70493

Snx12, Sorting nexin-12, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx12O70493 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snx12O70493 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snx12O70493 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snx12O70493 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snx12O70493 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Snx12O70493 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx12O70493 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx12O70493 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx12O70493 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx12O70493 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx12O70493 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Snx12O70493 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snx12O70493 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snx12O70493 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snx12O70493 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snx12O70493 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Snx12O70493 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snx12O70493 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snx12O70493 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snx12O70493 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snx12O70493 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snx12O70493 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx12O70493 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx12O70493 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snx12O70493 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snx12O70493 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx12O70493 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx12O70493 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx12O70493 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx12O70493 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx12O70493 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx12O70493 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snx12O70493 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snx12O70493 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snx12O70493 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Snx12O70493 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Snx12O70493 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Snx12O70493 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Snx12O70493 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx12O70493 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx12O70493 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx12O70493 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx12O70493 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx12O70493 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx12O70493 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snx12O70493 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snx12O70493 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx12O70493 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx12O70493 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx12O70493 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snx12O70493 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snx12O70493 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx12O70493 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx12O70493 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx12O70493 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx12O70493 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Snx12O70493 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Snx12O70493 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx12O70493 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx12O70493 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx12O70493 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx12O70493 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx12O70493 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx12O70493 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx12O70493 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx12O70493 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx12O70493 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx12O70493 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx12O70493 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx12O70493 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx12O70493 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx12O70493 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx12O70493 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx12O70493 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx12O70493 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx12O70493 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx12O70493 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx12O70493 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx12O70493 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx12O70493 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx12O70493 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx12O70493 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx12O70493 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx12O70493 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx12O70493 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx12O70493 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx12O70493 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx12O70493 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snx12O70493 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snx12O70493 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx12O70493 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx12O70493 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx12O70493 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx12O70493 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx12O70493 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx12O70493 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx12O70493 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx12O70493 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx12O70493 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx12O70493 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms