Protein–RNA interactions for Protein: O70404

Vamp8, Vesicle-associated membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp8O70404 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp8O70404 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp8O70404 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp8O70404 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp8O70404 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp8O70404 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp8O70404 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp8O70404 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp8O70404 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp8O70404 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp8O70404 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp8O70404 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp8O70404 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp8O70404 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp8O70404 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp8O70404 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp8O70404 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp8O70404 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp8O70404 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp8O70404 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp8O70404 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp8O70404 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp8O70404 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp8O70404 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp8O70404 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp8O70404 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp8O70404 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp8O70404 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp8O70404 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp8O70404 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp8O70404 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp8O70404 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp8O70404 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp8O70404 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp8O70404 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp8O70404 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp8O70404 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp8O70404 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp8O70404 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp8O70404 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp8O70404 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp8O70404 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp8O70404 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp8O70404 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp8O70404 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp8O70404 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp8O70404 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp8O70404 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp8O70404 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp8O70404 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp8O70404 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp8O70404 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp8O70404 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp8O70404 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp8O70404 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp8O70404 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp8O70404 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp8O70404 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp8O70404 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp8O70404 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp8O70404 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp8O70404 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp8O70404 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp8O70404 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp8O70404 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp8O70404 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp8O70404 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp8O70404 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp8O70404 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp8O70404 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp8O70404 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp8O70404 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp8O70404 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp8O70404 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp8O70404 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp8O70404 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp8O70404 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp8O70404 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp8O70404 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp8O70404 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp8O70404 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp8O70404 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp8O70404 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp8O70404 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp8O70404 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp8O70404 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp8O70404 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp8O70404 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp8O70404 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp8O70404 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Vamp8O70404 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp8O70404 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp8O70404 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp8O70404 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp8O70404 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp8O70404 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp8O70404 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp8O70404 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp8O70404 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp8O70404 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms