Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Pik3cdO35904 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pik3cdO35904 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pik3cdO35904 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pik3cdO35904 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pik3cdO35904 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pik3cdO35904 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pik3cdO35904 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pik3cdO35904 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pik3cdO35904 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pik3cdO35904 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pik3cdO35904 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pik3cdO35904 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pik3cdO35904 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pik3cdO35904 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pik3cdO35904 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pik3cdO35904 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pik3cdO35904 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3cdO35904 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3cdO35904 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3cdO35904 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3cdO35904 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3cdO35904 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pik3cdO35904 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pik3cdO35904 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pik3cdO35904 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pik3cdO35904 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Pik3cdO35904 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3cdO35904 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3cdO35904 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3cdO35904 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3cdO35904 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pik3cdO35904 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pik3cdO35904 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pik3cdO35904 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pik3cdO35904 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pik3cdO35904 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pik3cdO35904 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pik3cdO35904 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pik3cdO35904 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pik3cdO35904 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pik3cdO35904 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pik3cdO35904 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pik3cdO35904 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pik3cdO35904 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pik3cdO35904 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pik3cdO35904 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pik3cdO35904 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pik3cdO35904 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pik3cdO35904 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pik3cdO35904 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pik3cdO35904 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pik3cdO35904 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pik3cdO35904 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pik3cdO35904 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pik3cdO35904 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pik3cdO35904 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pik3cdO35904 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pik3cdO35904 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pik3cdO35904 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pik3cdO35904 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pik3cdO35904 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pik3cdO35904 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pik3cdO35904 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pik3cdO35904 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pik3cdO35904 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pik3cdO35904 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pik3cdO35904 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pik3cdO35904 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pik3cdO35904 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pik3cdO35904 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pik3cdO35904 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pik3cdO35904 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pik3cdO35904 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pik3cdO35904 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pik3cdO35904 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pik3cdO35904 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pik3cdO35904 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pik3cdO35904 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pik3cdO35904 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pik3cdO35904 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pik3cdO35904 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pik3cdO35904 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pik3cdO35904 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pik3cdO35904 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pik3cdO35904 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pik3cdO35904 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pik3cdO35904 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pik3cdO35904 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pik3cdO35904 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pik3cdO35904 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pik3cdO35904 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pik3cdO35904 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pik3cdO35904 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pik3cdO35904 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pik3cdO35904 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pik3cdO35904 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pik3cdO35904 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pik3cdO35904 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pik3cdO35904 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms